用于数据回溯及单碱基突变智能识别的DNA电路的构建研究

来源 :深圳大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jinr0op3
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基于DNA纳米材料,研究者们设计了多种链置换反应,并基于链置换反应构建了可进行逻辑判断,信息保护,可重用,可进行信号扩增,可用于核酸检测的功能电路等等。这些功能电路已经在各自的领域得到了广泛的应用。尽管如此,现有的功能电路尚无法满足所有研究需求,仍存在部分问题尚未解决。其一,现有的DNA功能电路无法对电路中间输出的数据进行回溯;其二,单碱基突变检测电路无法一次性识别检测多条同源DNA。围绕着这些问题。本论文提出了用于数据回溯及单碱基突变智能识别的两种DNA功能电路。利用Nupack软件对设计出的电路进行仿真检测,交叉比对电路中DNA分子之间的杂交性质和抗干扰能力,设计筛选出符合实验设计的碱基序列,并利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和荧光光谱实验对电路的运行过程与结果进行验证。本文的主要内容如下:第二章:与硅基计算体系相似,DNA计算体系在数据传输过程中也很难避免产生传输错误数据的情况,严重地影响常规逻辑计算的结果可靠性。为了解决该问题,我们将数据冗余编程思想融入到DNA逻辑电路的设计中,构建出可进行数据回溯的功能电路。根据冗余的思想,在电路的逻辑门单元上构建出与计算模块等效的冗余模块,使得冗余报道模块在报道冗余模块的信息时等效报道上级逻辑门的信息,从而实现对该级逻辑门输出状态的记录。根据冗余报道模块所报道的信息与真值表的比较,可以对最终电路计算结果的真实性进行验证。而逻辑门输出状态的回溯可以帮助我们在计算结果错误时准确找到电路的错误位置,从而对电路进行改善设计。第三章:生物体中具有多条同源寡核苷酸链,彼此仅有一个碱基差异,具有不同的生物学意义。若是利用传统方法对每一条核苷酸进行特异性检测则需要相应数目的识别探针进行一对一的检测。这会使得检测效率低下。为了解决该问题,我们尝试将DNA逻辑电路的组合逻辑判断功能应用到单碱基突变的检测中,使能够对多个输入进行分析判断。因此,我们设计了具有分子诊断功能的4-2编码器电路,该电路可以对四种同源寡核苷酸中的单碱基突变位点进行准确的识别。首先根据四个同源寡核苷酸分子信息的差异,以分子信息作为输入构建了两个2-1编码器,再将两个2-1编码器组合构建4-2编码器。该4-2编码器可以将4条同源DNA的分子信息转换为4种不同组合的荧光信号。因此,我们可以基于输入和输出之间的一一对应关系实现四种同源性极强的DNA的单碱基突变识别。
其他文献
随着社会的发展,科技的进步,人们对高性能碳材料的需求也越来越大,因此高性能碳材料的研发与制备成为人们研究的重点,其中高性能碳纤维因其具有质轻、强度高、耐腐蚀等特点被广泛的应用在了国防、航空航天等领域。但是,目前国内对于高性能碳纤维的研究仍略有不足,难以自主制造高性能碳纤维。因此,高性能碳纤维的制备与研究是一个重要的研究方向。本论文第3章使用自由基溶液聚合的方法在聚丙烯腈(PAN)主链引入了含有磺酸
为杀灭有害病原体、保护人体健康,饮用水消毒是必不可少的水处理工艺。但消毒剂与原水中有机物反应会产生各种消毒副产物(DBPs)而对人体健康造成潜在威胁。因此,有必要采取有效措施控制饮用水中的DBPs。吸附法被研究人员广泛应用在水体污染物的控制中。本研究第一部分以棉纤维为改性基底材料,通过紫外辐照和氧化还原反应将聚甲基丙烯酸缩水甘油酯(PGMA)聚合物刷接枝到棉材料表面,再通过胺化反应接枝二乙烯三胺(
打造全球金融科技中心是深圳金融业未来五年的关键和核心任务。需要聚焦“创新”、“先行”与“全球标杆”三大主题,探索一条金融与高科技产业良性互动和融合发展的长远之路;在重大制度创新方面,深圳需要注重金融科技产业的顶层设计、顶层推动和顶层监管,通过顶层立法和特区立法相结合的形式实现金融科技的法治化发展,并积极推动技术、资金、政策、人才和市场要素与国际规则和标准接轨;在重点领域方面,深圳可以围绕数字金融、
硫酸钙晶须应用范围广,综合性能优异,性价比高,具有良好的应用前景。以氯化钙为主要原料,添加油酸钠、硬脂酸钠以及油酸钠与硬脂酸钠混合物作为改性剂,采用常压酸化法,制备长径比高、疏水性能好的硫酸钙晶须。探究氯化钙浓度、反应时间、反应温度、油酸钠、硬脂酸钠及其混合物用量等因素对制备硫酸钙晶须长径比及疏水性能的影响,确定最佳制备条件。采用扫描电镜(SEM)、接触角测量仪、X射线衍射仪(XRD)、红外光谱(
多酚化合物在医药和美容产品,以及保健和功能性食品的研究和开发方面受到广泛的关注和重视,主要因为其具有良好的抗炎、抗肿瘤、抗心血管疾病和抗衰老等活性,具有较大的应用价值。无机—有机杂化纳米材料是一类由金属离子和有机成分自组装而成的,具有纳米级大小的较新颖的材料,具有多层次结构和较大比表面体积等优点,作为酶的固定化载体体现了很多优越的性能。酶交联聚集体(Cross-Linked Enzyme Aggr
以2014—2019年江苏省13个地级市为样本,构建中介效应模型,从收入来源渠道角度检验金融科技对江苏省农民增收的影响,并对粮食主产区和非粮食主产区进行异质性检验。结果表明:金融科技对农民收入具有显著促进作用;中介效应检验得知,金融科技通过促进非农就业增加工资性收入,影响农民增收,但不存在金融科技通过提高农业全要素生产率、第一产业固定资产投资以及财政支农强度促进农民增收的中介效应;区域异质性分析得
【目的】探讨柴胡加龙骨牡蛎汤治疗少阳郁火型2型糖尿病合并抑郁状态(消渴郁证)患者的临床疗效及其可能的作用机制。【方法】将70例少阳郁火型2型糖尿病合并抑郁状态(消渴郁证)患者随机分为试验组和对照组,每组各35例。对照组患者给予控制血糖、血压、血脂等西医常规治疗,试验组在对照组的基础上给予柴胡加龙骨牡蛎汤口服治疗,疗程为12周。观察2组患者治疗前后中医证候积分、汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分、空腹
随着智能制造在工业生产中的推广与应用,工业检测面临着从人工目检到机器视觉的转型,检测算法是机器视觉检测的核心部分,直接关系到机器视觉检测的稳定性和效率。因此,研究稳定和高效的检测算法具有重要意义。本文在长沙市科技局重点项目课题的支持下,对某套装玩具的缺陷检测进行了研究,针对该玩具多品种小批量的特点,从传统图像处理方法和深度学习方法两个方面,提出了适用的缺陷检测算法,完成了对玩具的缺陷检测。本文主要
针对复杂场景下仅依靠传统的目标检测与跟踪算法进行跟踪时准确度低且速度慢的问题,提出一种基于GhostNet与注意力机制结合的行人检测与跟踪算法。首先,将YOLOv3的主干网络替换为GhostNet,保留多尺度预测部分,利用Ghost模块减少深度网络模型参数和计算量,在Ghost模块中融入注意力机制给予重要特征更高的权值。然后,引入目标检测的直接评价指标GIoU来指导回归任务。最后,利用Deep-S
随着经济的快速发展,物流配送需求也急剧增加且配送场景呈现多元化特点。对于物流配送常见的带时间窗多行程车辆路径问题(MTVRPTW),本文研究第一层级优化目标为最小化配送迟到时长和工作超时时长,第二层级优化目标为最小化车辆的数目,第三层级优化目标分别为最小化总体在途时长和最小化总体工作时长的MTVRPTW问题。本文研究不同优化目标下的MTVRPTW问题,并对不同优化目标下的MTVRPTW问题进行模型