甜叶菊是一种富含糖苷的、菊科多年生草本新型经济作物,常用于食品和制药工业[161]。甜叶菊是我国出口创汇及改善人民生活的优势产业,我国甜叶菊种植面积大,是世界出口大国。甜叶菊叶片产量和品质是鉴定甜叶菊优劣的决定性因素。当前甜叶菊育种工作的热点仍然是选育优良高糖苷的甜叶菊品系。DNA分子标记是新兴的遗传标记,与形态,细胞和蛋白质标记相比,其特点是快速,简单,成本低,遗传多态性高,重复性好,已被普遍应用于各类作物遗传多样性分析和辅助选取目的标记以辅助育种等范畴。掌握甜叶菊遗传材料和了解其农艺性状遗传基础有助于甜叶菊品系的优化。因此,甜叶菊重要农艺性状关联分析对开发使用甜叶菊重要的农艺性状基因和甜叶菊DNA分子辅助遗传育种意义重大。本文以甜叶菊自然群体为研究材料,甜叶菊主要农艺性状统计分析——描述性、简单相关性和偏相关性分析、主成分分析和聚类分析,EST-SSR标记遗传多样性和群体间遗传关系分析,基于以上分析基础,对EST-SSR标记与农艺性状进行关联分析,获得重要农艺性状EST-SSR标记[162-165],取得以下重要结果:1.甜叶菊农艺性状分析:结果表明,这1 1个性状的变异性差异较大,干重变异系数最大,变异系数为119.49%,其次是分枝数和STV,变异系数介于53.34%～69.99%,株高、茎粗、节数、RA、RC、RD、总苷、RA/总苷变异系数均小于35%,阐明甜叶菊关联分析群体表现型差异大,具备比较丰富的多样性,能够为甜叶菊育种供应充足的育种资料[162]。相关性和偏相关剖析得知:干重与株高、茎粗、分枝和节数之间呈极显著的正相关,所以不妨选择枝叶茂盛的高大植株建立高产型甜叶菊品种;RA与干重之间呈显著正相关,与STV呈极显著的负相关,故选取优良甜叶菊品种要妥善协处理好RA和STV两者之间的关系。选取欧式距离为5.0处,可将93份甜叶菊品系聚为5大类。主成分分析表明,4个特征值的累积贡献率达到85.945%,认为这4个主成分可以概括绝大多数相关信息。2.DNA遗传多样性分析:对93份甜叶菊材料进行遗传多样性分析,结果表明,58对EST-SSR引物在93份材料中扩增得到1052个等位基因,多态性高达91.38%,每一个位点平均有18.1个等位基因。说明关联群体遗传差异大,可以用于关联分析。聚类分析结果表明,欧氏距离为14时,所有甜叶菊材料被分为五大类群。比较两种聚类结果,建立在EST-SSR分子标记的聚类结果表明,多数具有相同遗传背景的甜叶菊为一类;而在表观性状聚类中,遗传背景不同的甜叶菊品种资源初步推断也聚在同一类。3.甜叶菊重要农艺性状GWAS分析:利用TASSEL 5.0软件中的一般线性模型,主成分分析评价群体结构作为协变量,对93份甜叶菊品系的11个农艺指标GWAS分析,获取10个与6个农艺性状指标(株高、茎粗、节数、RD、STV、总苷)在0.01水平上显著关联的EST-SSR标记,证明了 EST-SSR标记可用于93份甜叶菊资源聚类分析。