【摘 要】
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目的:人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1),作为获得性免疫缺陷综合征(AIDS)(又称艾滋病)的主要病原体亚型,具有较高的传染性及较强的致病性。实现精准的HIV-1感染检测在AIDS的诊断、治疗、防控中起着至关重要的作用。目前,针对机体产生的特异性免疫抗体的血清学检测是HIV-1感染实验室诊断的主要手段。然而抗体产生前的“窗口期”阻碍了对感染结果的早期判断。另外,针对HIV-1核酸的实时荧光定量PC
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目的:人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1),作为获得性免疫缺陷综合征(AIDS)(又称艾滋病)的主要病原体亚型,具有较高的传染性及较强的致病性。实现精准的HIV-1感染检测在AIDS的诊断、治疗、防控中起着至关重要的作用。目前,针对机体产生的特异性免疫抗体的血清学检测是HIV-1感染实验室诊断的主要手段。然而抗体产生前的“窗口期”阻碍了对感染结果的早期判断。另外,针对HIV-1核酸的实时荧光定量PCR(qPCR)检测,虽然不存在“窗口期”的漏检,但是其对人员、设备要求高。为了更好地满足实验室对HIV-1检测方法的需求,本研究提出了一个简单、灵敏的全核酸级联反馈放大策略,对HIV-1相关DNA(HIV-1 DNA)进行了无蛋白酶参与的均相检测,以期为早期HIV-1感染提供新的检测思路。方法:1.反应过程:当目标DNA存在时,通过目标驱动的催化发夹组装(CHA)循环反应,依次打开发夹H1和H2,形成双末端具有活性DNAzyme的H1-H2杂交双链。其进一步循环剪切含rA切割位点的荧光淬灭发夹底物H3,以产生明显放大的荧光信号。同时,释放的淬灭基团标记片段作为目标DNA类似物也能再次催化CHA-DNAzyme反应过程。2.验证放大效率:通过改变H1和H2中部分DNAzyme序列为聚T序列,比较生成的单端DNAzyme双链H1T-H2,H1-H2T与双端DNAzyme双链H1-H2在反应体系中的放大效率;通过改变H3中部分目标序列为聚T序列,进而验证目标DNA类似物参与的反馈放大对检测灵敏度的影响。3.评估检测性能:对H3浓度,反应温度,时间等相关实验条件进行优化后,通过检测不同浓度目标DNA的荧光信号变化,对该方法的灵敏度、线性范围、特异性等进行了评价。结果:1.双端DNAzyme的荧光强度增量是单端DNAzyme的荧光强度增量的3倍以上;目标DNA类似物参与的自催化反馈放大能够提高CHA-DNAzyme传感系统的灵敏度。2.在最优的实验条件下,该方法对HIV-1 DNA的线性检测范围为1 pM到2 nM,可检测的最低浓度为1 pM,且具有较高的特异性和良好的检测重复性。3.添加目标DNA的回收率为94.48%-103.26%,相对标准偏差(RSD)为2.02%-5.40%,表明该方法具有在复杂生物基质中检测目标DNA的应用潜力。结论:本研究结合CHA回路,依赖Mg2+的DNAzyme循环剪切反应及目标DNA类似物的反馈效应,成功地构建了一种用于检测HIV-1 DNA的等温荧光传感方法。由于多个放大设计的协同作用,该方法实现了对目标DNA灵敏的检测。鉴于核酸探针具有可编程的特性,当前的策略可为广谱分子生物标志物的检测提供一种前瞻性设计。
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