随着国家深入实施创新驱动发展战略,加快建设创新型国家步伐,推动经济高质量发展,科技创新作为着力点和核心驱动力,其重要性与日俱增。教育部直属985高等学校作为我国知识创新和技术创新的一支重要力量,科研投入产出情况受到广泛关注并引发热烈讨论。因此,科学分析科研投入对产出的影响程度,有助于高效配置利用科研资源,释放科技创新动能,对提升我国科技竞争力具有很强的理论意义和现实意义。本文以教育部直属985高等学校为研究对象,利用理论研究与实证分析相结合、定性描述与定量分析相结合的研究方法,以2009年至2017年高等学校科技资料统计汇编数据为数据来源。首先对其科研投入产出现状进行详细分析,研究发现教育部直属985高校在科研人员和经费投入的水平上均有所提高;高校科研产出方面,科技著作和发表论文数量均大幅提升,专利授权产出水平稳中有进,但将专利成果转化为经济效益水平仍有待提升;校际间各所高校的科研产出总体水平截然不同。接着基于面板数据,建立随机效应模型,从整体层面、地域差异、办学类型三个方面系统分析教育部直属985高校科研投入对产出影响的回归分析结果。本文研究结论得出,整体层面上教育部直属985高等学校科研投入对产出具有明显推动作用;科研经费相比于人员投入影响程度更强烈。具体表现为科研人员投入增加1%时,科研产出水平平均增加0.2172%;科研经费支出增加1%时,科研产出水平平均增加0.3171%。控制变量中社会资本系数绝对值最大,影响最为强烈,而地方经济实力估计系数为负且绝对值较小,影响较为微弱。分样本回归结果显示,科研人员与经费投入分别对中西部地区和东部地区高校的科研产出水平影响正向效果显著,控制变量方面,东部地区科研人才影响明显,中西部地区教育投入影响程度较强。其他类高校科研人员投入对产出的影响程度强烈,综合类和工科类高校科研经费投入对产出的影响程度明显。控制变量中三类高校的社会资本估计系数绝对值较大,科研人才数量都在5%的水平上正向显著,综合类和工科类两类高校控制变量校企研发合作水平和教育投入力度均呈正向积极影响作用。本文研究同时反映出一些问题,如高等学校的科研投入效果不佳,科研资源配置不够合理,科研投入与产出未能良性匹配。高等学校科研投入对产出的影响估计系数在地区间存在较大差距,中西部欠发达地区的影响估计系数明显低于东部经济发达地区。最后本文建议应加强人才队伍建设,建立有效激励机制;拓宽经费来源渠道,优化资源配置结构;升级科研交流平台,提高创新成果质量;推进产学研相结合,完善科学评价体系。