新疆猪源葡萄球菌cfr和fexA基因及其遗传元件的检测分析

来源 :新疆农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gfdsa008
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为了调查新疆主要猪场生猪在不同季节(夏季和冬季)和不同部位(鼻腔和直肠)分离的葡萄球菌的耐药情况,同时对氟苯尼考低敏感菌株进行相关耐药基因检测,对阳性菌中的遗传元件进行分析,探索耐药基因在菌间可能存在的传播机制。首先采用微量肉汤稀释法对不同部位分离出的葡萄球菌进行临床9种常用抗菌药物的药敏试验;对耐药结果使用SPSS软件进行卡方检验,比较不同部位分离出的葡萄球菌耐药的差异性。接着对分离的葡萄球菌通过PCR方法进行cfr、fexA和fexB基因检测,将携带cfr、fexA和/或fexB阳性菌株用16S rRNA序列扩增进行种属鉴定,同时对影响cfr、fexA和/或fexB基因传播的移动元件IS21-558(包括:istAS和istBS)和Tn558转座酶基因(包括:tnpA、tnpB、tnpC)进行检测,推测引起cfr、fexA和/或fexB基因在葡萄球菌中可能存在的传播机制。具体结果如下:  1.新疆主要养猪场不同部位分离的葡萄球菌耐药结果显示:直肠分离的葡萄球菌除左氧氟沙星、苯唑西林和克林霉素外,对阿米卡星、庆大霉素、四环素、氟苯尼考、利福平和阿莫西林/克拉维酸6种抗菌药物的耐药率均比鼻腔分离的葡萄球菌的耐药率高出20.28%、17.41%、7.35%、8.60%、9.31%和11.56%。直肠分离的葡萄球菌在8耐和9耐的多药耐药率比鼻腔分离的葡萄球菌多药耐药率依次高出17.2%和4.5%。直肠分离的葡萄球菌耐药谱型主要以TE-FFC-DF-A/C-OX-CM-GEN-RFP(39/95,41.1%)8耐的耐药谱型为主,鼻腔分离的葡萄球菌耐药谱型主要以TE-FFC-DF-A/C-OX-CM-RP(28/150,18.7%)7耐的耐药谱型为主。  2.新疆主要养猪场夏、冬两季不同部位分离的葡萄球菌耐药结果:夏季鼻腔分离的葡萄球菌对阿米卡星、氟苯尼考、氧氟沙星、苯唑西林和克林霉素5种抗菌药物的耐药率比冬季鼻腔菌依次高出50.4%,1.9%,9.3%,4.6%和4.8%。夏季直肠分离菌对庆大霉素、四环素、利福平、氧氟沙星、苯唑西林、阿莫西林/克拉维酸和克林霉素7种抗菌药物的耐药率较冬季分离的直肠菌下降17.8%、24.2%、13.3%、6.9%、2.0%、4.2%和6.7%。夏季直肠分离的葡萄球菌8耐的多药百分率由22.0%上升到冬季直肠菌的38.5%,且冬季直肠菌的8耐百分率显著高于夏季直肠分离菌(P<0.05)。冬季直肠分离的葡萄球菌1耐、2耐、3耐和8耐的多药百分率均较夏季直肠分离菌的多药百分率高,依次高出0.1%、0.7%、6.8%和16.5%。夏季鼻腔分离的葡萄球菌在2耐、3耐、7耐、8耐和9耐的多药百分率均较冬季鼻腔分离菌的多药百分率低,依次降低2.4%、2.8%、2.8%、7.3%和0.2%,且夏季鼻腔菌的6耐百分率显著低于冬季鼻腔分离菌(P<0.05)。  3.通过对cfr、fexA和fexB基因筛查,葡萄球菌cfr、fexA和fexB基因的检出率依次为0.34%、0.51%和0%。在携带cfr和fexA阳性菌株检出IS21-558移动元件(istAS,istBS)和Tn558转座子的转座酶基因(tnpA,tnpB,tnpC),推测cfr和fexA基因在葡萄球菌中主要的传播方式是水平传播机制。  结论:不同季节和不同部位分离的葡萄球菌对临床常用抗菌药物耐药严重,直肠分离的葡萄球菌比鼻腔分离菌的耐药情况更严重;夏、冬两季不同部位分离的葡萄球菌其耐药率与养殖场季节性用药呈现季节相关性,冬季耐药情况高于夏季。cfr和fexA基因在不同种葡萄球菌属的种间检出,同时检出的移动元件和相关的转座酶基因进一步说明其在菌株间传播的风险较大,暗示上述被检基因在当地养殖场有可能在短期内流行或爆发。
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