广东茄科雷尔氏菌分离鉴定及rDNA遗传差异研究

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本文对分离自广东各地番茄、茄子、烟草、辣椒、空心菜、沙姜、姜、马铃薯、花生、菊花、桑树和藿香12种作物的21个茄科雷尔氏菌菌株进行了研究,其中12个代表菌株人工接种于6种寄主植物上致病性测定结果表明,沙姜菌株YC-5只侵染姜,不侵染其它5种作物,而姜菌株CW-10侵染姜和弱侵染番茄,不侵染其它4种作物;番茄菌株SSF-4、茄子菌株DG-2、辣椒菌株GY-1、马铃薯菌株HZ-2、花生菌株RR-2、菊花菌株FC-1、桑菌株MA和藿香菌株PC均侵染番茄和茄子,弱侵染辣椒,不侵染烟草、空心菜和姜;烟草菌株NX-1侵染番茄、茄子和烟草,弱侵染辣椒,不侵染空心菜和姜:空心菜菌株PY-10侵染番茄、茄子、空心菜,弱侵染辣椒,不侵染烟草和姜。因此,YC-5和CW-10应属于4号生理小种,其它10个菌株均属于1号生理小种。 对上述21个菌株的生理生化测定结果表明,菌株HZ-1属于生化变种Ⅱ,菌株ZCZ-2、LZ-3、GY-1、GY-2、HZ-2、NX-1、NX-5、RR-1、YC-33、MA和PC属于生化变种Ⅲ,SSF-4、DG-2、RR-2、PY-10、GY0501、YC-5、CW-1、CW-10和FC-1属于生化变种Ⅳ。可见,生化变种Ⅲ和Ⅳ是广东茄科雷尔氏菌优势生化变种。 利用原核生物16S rDNA通用引物1541r和27f扩增21个茄科雷尔氏菌菌株16SrDNA,结果表明,它们的16S rDNA序列全长均为1513 bp,其同源率为99.1%~100%,各菌株之间最多只有12个碱基差异,说明广东茄科雷尔氏菌16S rDNA序列高度保守。系统进化分析结果,菌株HZ-1处于一个分支,其余20个菌株均处于另一分支中。 利用原核生物16S-23S rDNA间隔区序列通用引物1493f和23r扩增21个茄科雷尔氏菌菌株16S-23S rDNA ITS,结果显示,除HZ-1菌株外,其余20个广东茄科雷尔氏菌菌株ITS序列长均为509 bp,序列间同源率99.2%~100%;而HZ-1菌株的ITS序列长为504 bp,与其它菌株的ITS序列同源率为93.9%~94.1%。这些结果说明,广东茄科雷尔氏菌的16S-23S rDNA ITS序列也很保守。系统进化分析显示,菌株HZ-1处于一个分支中,其余20个菌株处在另一分支中。
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