【摘 要】
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本文首先详细介绍了目前常见的几种DNA单分子操纵仪器,如光镊、磁镊、玻璃微针和原子力显微镜等技术,分析其优缺点.在此基础之上分析目前开展的几种DNA操纵实验及其结果.然后
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本文首先详细介绍了目前常见的几种DNA单分子操纵仪器,如光镊、磁镊、玻璃微针和原子力显微镜等技术,分析其优缺点.在此基础之上分析目前开展的几种DNA操纵实验及其结果.然后介绍目前普遍应用到的几种理论模型,着重介绍周海军等提出的梯子模型,在此之上提出我们的碱基水平DNA离散化弹性模型.基于我们的碱基水平DNA离散化弹性模型,本文首先详细讨论了单个DNA分子轴向的拉弹性,并且按照从简单到复杂的原则,详细分析了不同碱基对体系的拉伸结果.研究结果表明DNA碱基对一个一个相继打开形成DNA拉伸曲线的B-到S-DNA转变平台.模拟结果还发现DNA分子大沟与小沟结构对DNA的拉弹性的影响很小,不同超螺旋程度下DNA的拉伸结果符合单分子操纵实验得到的变化趋势.我们的模型暴露了DNA拉伸过程的序列相关性问题(即DNA拉弹性实验所得到的poly(GC)与λ-DNA的B-到S-DNA转变平台一致问题),对于该问题本论文从GC与AT含量及次近邻相互作用方面作了初步的探索.
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