猪流行性腹泻（porcine epidemic diarrhea，PED）能引起一周龄仔猪腹泻、呕吐、脱水乃至死亡的病毒性疾病。miRNA是一种长约22 nt的非编码单链小RNA，它是由基因组中某个转座子编码。　　为探究猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染猪小肠上皮细胞（intestine epithelial cells J2，IPEC-J2）后，对IPEC-J2 miRNA表达谱的影响，本实验将PEDV感染IPEC-J2，收获细胞并提取总RNA，进行Hiseq高通量测序，构建了感染组与未感染组的miRNA表达谱并进行聚类分析、GO（Gene ontology，GO）分析、KEGG （Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）代谢通路分析和差异分析，并通过过表达 novel-miR-877/311/604 及ssc-miR-219a mimic观察对PEDV在IPEC-J2中复制的影响,随后又对这些miRNA调控PEDV复制的分子机制进行初步探究。结果显示显著差异表达的已知miRNA有45个，显著差异表达的未知miRNA有249个，从其中随机挑选了差异较显著的16个miRNA使用qPCR进行验证，结果与测序结果一致；对这些miRNA测序结果进行GO分析，结果显示其广泛参与生物过程、细胞成分和分子功能的调节；通过 KEGG 代谢通路分析显示 miRNA 也参与Jak-STAT、Toll样受体等信号通路的调节。还找到三个可以抑制PEDV复制的miRNA，分别为novel-miR-604、novel-miR-877和ssc-miR-219a，并对其作用机制进行了初步摸索，排除了这三个miRNA直接多用于病毒基因组、作用于细胞凋亡、细胞周期的影响，并找到了几个疑似的靶基因，如 TGFβ1，TAP1，TP53BP2，NFTC2，DDX3X。目前国内外对 PEDV的研究在感染致病机理、免疫机制等方面知之甚少，所以深入探究 PEDV 感染过程中的调控机制将极大地促进对该病的了解和防控，本研究为认识miRNA在PEDV复制中起到的作用奠定了基础。