【摘 要】
:
胆囊癌是一种较为罕见的侵袭性胆道恶性肿瘤。胆囊癌的存活率低,预后差,已严重威胁人类的健康。目前仍缺乏有效的生物标志物和治疗靶标。我们分析了胆囊癌的基因表达数据来定义差异表达的基因(DEG)。然后,通过蛋白质功能相互作用(FI)网络分析寻找具有潜在生物学功能的模块标志物。最后,我们在80例胆囊癌组织中进行免疫组织化学染色(IHC)来评估这些功能模块基因的蛋白表达水平及其临床预后意义。生物网络分析确定
论文部分内容阅读
胆囊癌是一种较为罕见的侵袭性胆道恶性肿瘤。胆囊癌的存活率低,预后差,已严重威胁人类的健康。目前仍缺乏有效的生物标志物和治疗靶标。我们分析了胆囊癌的基因表达数据来定义差异表达的基因(DEG)。然后,通过蛋白质功能相互作用(FI)网络分析寻找具有潜在生物学功能的模块标志物。最后,我们在80例胆囊癌组织中进行免疫组织化学染色(IHC)来评估这些功能模块基因的蛋白表达水平及其临床预后意义。生物网络分析确定了五个功能模块:模块0包含了经典的癌症信号传导途径,例如Ras和PI3K-Akt信号通路;模块1-4分别涉及肌细胞,纤维蛋白原,细胞外基质和整联蛋白相关的基因。我们验证了在网络中心或模块关键功能节点的三个基因,分别是LIFR、PIK3R1和MMP12。通过免疫组化实验,我们发现它们在癌组织中的蛋白表达与配对的癌旁组织相比,LIFR(P=0.002)和PIK3R1(P=0.046)显著下调,而MMP12(P=0.006)显著上调。生存预后统计分析显示LIFR低表达的患者比高表达的患者的总生存时间更短(log-rank 检验,P=0.028),而 PIK3R1(P=0.053)和 MMP12(P=0.006)也是相同的趋势。进一步的多因素生存分析表明MMP12的蛋白表达(风险比率[HR]=0.429;95%%置信区间[CI]=0.198-0.930;P=0.032)是一个独立的预后因子。我们建立了一种基于高可信的疾病功能网络来挖掘生物标志物的方法,它揭示了 LIFR、PIK3R1和MMP12可以作为胆囊癌潜在的新型预后标志物。这些发现可以加速这种癌症的生物标志物发现和治疗进展。
其他文献
外伤性尿道狭窄是泌尿外科范畴内较为棘手的临床问题,随着现代社会发展及城市化进程的不断推进,包括交通事故、高空坠落等意外频发,骨盆骨折所致后尿道损伤的发生基数在不断
目的:比较异种骨材料Bio-Oss骨粉经侧壁开窗法植入上颌窦内后不同时期的成骨效果。方法:对24例(25侧)患者行侧壁开窗法上颌窦底提升植骨术,采用单纯Bio-Oss骨粉作为植骨材料
近20年太赫兹技术在通信、无损检测、成像等领域飞速发展,太赫兹频段的各类高性能天线需求日益增加。可重构反射阵列天线具有高增益、快速调制、波束扫描与波束合成的性能得
玄德是1930年代末在小说和童话两个领域进行文学创作的朝鲜现代作家之一。不同于当时的主流儿童文学把小说的重心放在儿童成长与情感发育,玄德摆脱了主流文学框架,在现实主义文学的领域创造出了属于自己的,独特的文学写作方式及书写方式。他的创作重点并不在于儿童小说的教训主义,而是把创作重点放在儿童的心理和行动上,并以充满童心的,以儿童的视角来描述的现实主义观点完成了作品。本文以“属下研究”的视角深层分析了玄
卷积神经网络(Convolutional Neural Network,CNN)是深度学习领域重要的模型之一,近些年来被广泛应用在图像视频处理等场景中。在图像识别任务中,CNN对图像特征的不变性和良
随着大数据技术的迅猛发展,全球范围内掀起了大数据技术研究的热潮。车站的货车运行故障动态图像检测系统(TFDS)用于检测货运列车部件状态,使用传统技术难以处理TFDS产生的海
我国是农业大国,每年产生的农业废弃物总量高居世界首位,农业废弃物的田间焚烧、丢弃造成了巨大的空气污染和资源浪费。同时以燃煤为能源的火力发电方式产生了大量的CO_2,因此若利用可再生的农业废弃物作为能源便可达到较好的经济效益。然而农业废弃物氯及碱金属含量高,在热利用过程中会带来严重的积灰、结渣、腐蚀等问题,严重威胁设备的安全、高效运行。高温时,氯的存在还会促进碱金属的释放,加重结渣腐蚀等问题,因此降
3μm中红外波段稀土掺杂氟氧微晶玻璃可结合氟化物纳米晶中稀土离子的最佳光谱性能和氧化物玻璃的极好的宏观性能(如高的光学透明性,良好的化学稳定性和热机械性能,可调的玻
多聚焦图像融合是图像融合领域的一个重要研究方向,其能有效克服光学镜头聚焦范围有限的缺陷,将目标场景中处于不同距离的所有景物都清晰地呈现在一幅图像中。这不仅能有效提
进入21世纪以来,社会发展变革的速率不断加快,对人才的需求也发生了转变。当前社会需要具备创新意识和实践能力的高素质、复合型人才,而在传统教学模式下显然难以实现这样的育才目标。基于这样的现实背景,项目化学习作为探究性学习的一种新型模式逐渐被国内外教育工作者所认识、接受、应用。它所蕴含的教学理念与新版地理课程标准中提倡的自主、探究、合作的学习方式不谋而合,将它运用在教学实践中也能为落实新课程改革理念提