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口蹄疫（Foot-and-mouth disease, FMD）是由口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus,FMDV）引起偶蹄动物的一种急性、热性、高度接触性传染病，传播迅速、感染率高。FMDV易感动物范围广，包括牛、猪、羊等20科的约70多种家养和野生动物。FMD一旦爆发将造成巨大的经济损失，因此世界各国对该病的研究极为重视，世界动物卫生组织（OIE）将其列为法定报告动物传染病。2010-2012年，我国及周边国家相继发生了O型Mya98谱系毒株引起的口蹄疫疫情，被全球广泛关注。流行病学数据显示，该毒株在猪群中广泛流行，并造成严重的的致病性，深入分析该流行毒株的序列变异，生物学特性，致病性差异，最终揭示出致病性变异的分子基础，对于防治和消灭FMDV具有重要意义。鉴于此，本研究收集了我国2010年～2012年年底Mya98口蹄疫流行毒株，对其进行毒株分离鉴定和VP1基因序列测定，并进行比对和分析，之后选择具有代表性的毒株：Mya98谱系牛源毒株O/BY/CHA/2010和猪源毒株O/GZ/CHA/2010进行全基因组比对分析，并对其进行生物学特性测定，获得以下结果：1.我国O型口蹄疫Mya98毒株源于东南亚国家，当前优势流行毒株与东南亚国家流行毒株同源性95%以上，属同一毒株。2.国内Mya98毒株随传入时间（或流行历史）的不同趋向于形成不同的进化分支，不同分支之间毒株差异较大，最大差异率可达15%。3.我国Mya98毒株宿主适应范围发生了转变，由最初只感染反刍动物变为猪、牛、羊均可感染。4.O/BY/CHA/2010和O/GZ/CHA/2010毒株与来自Mya98谱系的毒株全基因的核苷酸同源性大于98.0%。5.O/GZ/CHA/2010毒株在L蛋白第10位增加一个L氨基酸，在S片段缺失70个核苷酸。6.测定O/BY/CHA/2010毒株的LD50为8.0，TCID50为7.5；O/GZ/CHA/2010毒株的LD50为4.5，TCID50为4.5。