同源重组是一种在相同或接近的DNA序列中进行核酸序列交流的基因重组方式。细菌中主要包括两类起始双链DNA损坏的同源重组修复的途径,在一些细菌中以RecBCD路径作为起始方式,另一些以AddAB路径作为起始方式。蛋白质共进化是指一个蛋白发生改变导致与之相关的蛋白结构或功能发生变化。共进化使蛋白在物种中同时出现,协作以完成复杂的功能。检测蛋白质共进化的方法有多种,其中在蛋白水平最为成功的检测方法是检测成对蛋白家族的相似进化历史。本研究在RecBCD中找到了比以前研究更多的保守位点,将这些保守位点投影到RecBCD的3D结构上发现这些保守位点主要分布在DNA通道和各亚基间的接触面上。我们猜想这些位点的保守保证着DNA通道的畅通和亚基之间相互作用的稳定有效。此外,RecC上的Chi识别域也在3’-5’DNA通道附近,这样保证着识别域能够及时且地准确地识别Chi序列。我们用系统分析的方法将RecBCD和AddAB间的进化关系重现,发现RecBCD/AddAB在进化过程中经历了重组、复制、分化、水平基因转移和共进化等一系列事件。这些事件解释了RecBCD是怎样由一个简单的解旋酶最终演化成一个功能强大的重组修复酶。更进一步研究发现,Chi序列与识别位点间也经历了共进化。尽管RecBCD经历了一系列复杂的进化事件,但为了保证DNA通道的畅通和亚基之间相互作用的稳定有效,DNA通道和亚基间接触面上的很多位点仍然保守。