“道地药材”是具有中国特色的对特定产区的名优正品药材的一种特称，是中药学主要特色之一。道地药材与非道地药材的区分鉴别，目前主要依靠分子生物学及光谱分析等手段，但是较难与中医药理论和特色进行相关。 针对道地药材的中医药独特内涵，本文提出采用道地药材指纹图谱技术，旨在研究药材道地性的化学表达，分析鉴别道地药材的形成模式，寻找影响道地药材质量的因素。 本文结合化学计量学相关算法在样本分类与特征提取方面的特点，对川产道地药材川芎和藏药沙棘进行了如下色谱指纹图谱方法学研究： 川芎道地药材指纹图谱：该试验紧密结合“川芎生产质量管理规范”的研究，联系川芎传统用药基础，建立了川芎醇溶性部位指纹图谱与川芎水溶性部位指纹图谱。通过聚类分析、主成分分析等化学计量学方法的对比，阐述了道地药材的化学特征表达基础，认为川芎道地性与特征色谱指纹图谱所表达的化学成分含量信息密切相关。上述研究为提高川芎道地药材品质及药材的规范化提供了进一步科学依据。 藏药沙棘指纹图谱：该试验建立了沙棘总黄酮部位的指纹图谱，运用相似性算法、主成分分析对川产野生沙棘、沙棘制剂原料进行了质量评价，通过与沙棘制剂相对比，初步分析了沙棘的药效物质基础。 在上述实验的基础上，本文全面探索和建立了道地药材指纹图谱研究内容、研究原则及研究方法。强调了代表类群选择、有针对性的化学计量学方法以及药效学试验三者对道地药材指纹图谱信息提取及道地特征确定的支撑作用。 综上所述，道地药材指纹图谱是多学科交叉探索道地性药材内在规律的可行方法，无论是从研究思路还是方法学方面，对揭示道地药材的科学内涵都具有重要意义。