近些年来,我国高等院校的成长速度有目共睹。而随着不断地成长,高校也迎来了很多的挑战,高等院校获得收入的途径也越来越多,业务内容也不再单一。因此高等院校一定要加强内部控制,才能够更好地应对快速成长所带来的潜在风险。但是高等院校身为事业单位,科研和教学才是长久以来的活动重心,高校对于经济活动的重视程度较低,这也是为什么目前看来高等院校很难跟上现在其高速成长的原因,故此高等院校必须要重视其内部控制工作。但现在,我国专门针对高校内部控制的研究比较少,即使有,也是大多数借鉴了适用于公司的COSO内部控制结构,不仅如此,绝大部分是基于公司实际情况所实行的内部控制理论,并且很多都是参照美国的报告,中国高等院校以这些研究作为基础,结合自身情况进行了完善。虽然如此,但是现有的内控研究还是较缺少可操作性,对高等院校进行内部控制工作能起到的帮助较少。因此本论文先是回顾了高等院校内部控制研究的发展历程,并且将《行政事业单位内部控制规范(试行)》以及《教育部直属高校经济活动内部控制指南(试行)》两篇相关文件作为基础进行进一步的探究,同时结合《S省省属院校经济活动内部控制实施指南(试行)》,试图构建更符合我国高等院校现状的内部控制框架。研究思路如下:第一步是探究有关内部控制的最根本的理论以及相关的制度背景,还将参考相关的资料文献,剖析高等院校在内部控制方面具备的特性、内部控制想要达到的目的还有对高等院校未来发展的影响。这里将把S高校作为研究对象,分析目前该校内部控制的情况,还会进一步剖析其在内部控制中所出现的各类情况。并且针对发现的问题,及时预防高校在进行经济活动时可能会出现的问题,进一步让S高校的内部控制制度趋于完整。主要针对单位层面以及业务层面的预算管理、收支管理、政府采购管理、国有固定资产管理四个业务层面提出了完善S高校内部控制制度的方法,在实践上有一定的意义。总之,希望能通过此研究,给高校加强和完善内部控制制度提供一些新的思路,保障高等院校能够更好更高效地开展经济活动工作、保障国有资本不必流失、最重要的是能使科研、教学和管理更加有序的进行。希望此研究可以为我国各高校内部控制制度的完善提供一些参考意见。