随着知识经济的兴起并迅速发展，科技创新已经成为推动世界经济发展的关键因素，自主创新能力成为衡量一国综合国力的核心指标日益受到世界各国政府的关注。如何提高自主创新能力以增强国家和企业的核心竞争力已经成为各国制定政策的依据。其中，企业所得税政策是作为国家宏观调控的有效手段受到各国政府的重视。如何充分利用企业所得税优惠政策支持自主创新已经成为我国当前迫切需要研究的课题。本文采用理论分析与实证分析相结合的方法深入研究我国企业所得税优惠政策对自主创新的影响。首先阐述企业所得税优惠政策支持自主创新的理论依据，其次对我国自主创新的现状以及鼓励我国自主创新的企业所得税优惠政策的现状进行全面的梳理，并从实证研究和机理分析两方面深入探讨我国企业所得税优惠政策对自主创新的影响及作用机理，进而提出促进我国自主创新的企业所得税优惠政策的改革思路。本文研究的主要结论如下：第一，对我国鼓励自主创新的企业所得税优惠政策分税收减免、税前扣除、加速折旧和投资抵免四个方面进行归纳梳理，总结出以下几点问题：现行自主创新企业所得税政策零散，缺乏系统性和规范性；忽视对科技成果转化的扶持，优惠形式单一，以直接优惠方式为主。第二，通过建立模型，实证分析我国企业所得税优惠政策对自主创新的影响，得出我国企业所得税优惠政策在影响自主创新能力上有着正向激励的作用；并且从理论上研究企业所得税优惠政策对自主创新的影响机理，深入剖析不同税收优惠方式对自主创新具有不同的影响机理。第三，在理论及现状分析的基础上，依据实证分析的结果，提出促进我国自主创新的企业所得税优惠政策的改革思路，以求政府制定的企业所得税优惠政策对自主创新的激励作用更加明显且更具效率。