新型农村合作医疗(简称新农合)是我国社会基本医疗保障制度的一个重要组成部分,与城镇职工基本医疗保险、城镇居民基本医疗保险共同构成我国社会基本医疗保险体系。我们在看到我国的新农合发展迅速的同时,也看到了其在发展过程中所存在的公平性与效率性问题,而相对于新农合制度中所存在的被反复讨论的公平性问题,其效率状况更为值得关注。新农合制度中的效率问题究其本质应该是新农合基金运作中所存在的效率性问题。以辽宁省为例,新农合政策实施后的几年来其在基金的筹集使用方面存在着效率过低的问题。辽宁省是全国新农合发展状况的一个缩影,它的成就和存在的问题,既具有其个性,也必然具有共性。本文首先围绕新农合基金使用效率中所存在的问题,广泛研读国内外已有的关于效率性及相关新农合研究的理论和实证研究资源,并确定了数据包络分析作为本文的研究方法。由于该方法无需预先作任何参数假设,也无需对评价数据作无量纲化处理,因此在效率评估方面具有独特的优越性。接着以2006-2009年辽宁省新农合数据为基础,使用数据包络分析的方法对辽宁省新农合基金运行过程中的效率问题进行了实证研究,并就改进效率性提出了自己的见解。文章具体包括五个部分：首先,介绍了文章的研究背景和意义,对国内外关于效率性评价方法和新农合实施过程中所存在效率问题做出了较为详细的阐述。同时提出自己的研究思路和研究方法。第二,本文对研究过程中所使用的数据包络分析(DEA)方法做出了系统的介绍与评价,在众多评价效率性问题的方法中,数据包络分析方法是比较适用于研究辽宁省新农合基金筹集和使用过程中存在的效率性问题的方法之一。同时结合新农合基金筹集的情况本文选择了输入作为导向。第三,使用规模可变的传统DEA模型与超效率DEA模型,以2006-2009年辽宁省新农合数据作为基础进行效率性分析,在这个研究过程中某些地区投入资金过多,产出过少或者规模无效等许多低效问题都被发现,并对其产生的可能原因进行了合理性分析。第四,使用malmquist全要素生产率指数分析辽宁省新农合基金筹集使用效率的进步程度状况。在这一分析过程中会将全要素生产率的变化分解为技术效率的变化与技术的进步,同时得到技术在2007-2008年退步的结论。第五,对之前所发现的问题进行概括总结,并在此基础之上根据上述分析提出了关于基金效率改进的一些建议和看法,如适当降低投入金额,适应医疗补助需求；以省、市为单位,统筹规划市内各县基金的资金调配；推进政策的改革,提高农民的医疗补偿效率。