基于转录组测序技术的大银鱼胚胎盐胁迫适应分子机理研究

被引量 : 8次 | 上传用户:liaoyongsheng123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]目前,关于鱼类能在不同盐度环境下生存机制的研究主要集中在发育成熟的鱼上,而对于生命始源-胚胎的适应性调节研究较少。本论文选取河口鱼类中代表性物种大银鱼为研究对象,首次从转录组角度研究大银鱼胚胎在广盐梯度环境下其适应的分子机制,探索大银鱼胚胎渗透调节特性,为进一步探讨水生物通过自身调节适应环境奠定理论基础,对了解物种生存和分布格局具有重要科学意义。[方法1将采集的新排出大银鱼随机分成两组,依次为:对照组(淡水孵化组)、处理组(15‰盐水孵化组),每组设立三个组内平行,分别是对照组1(ctrl-1)、对照组2(ctr l-2)及对照组3(ctrl-3),盐处理组1(salt-1)、盐处理组2(salt-2)及盐处理组3(salt-3),同等条件下孵化。用第二代测序技术对大银鱼胚胎转录组进行测序,依据Phrap算法使用BLAST、GO-Term Finder软件得到其基因转录的详细信息,进一步数据分析后获得本实验的靶向基因,应用Real-Time PCR方法验证部分靶向基因,从基因转录组水平上深入揭示盐适应性调节机理。[结果]1.在对大银鱼胚胎转录组测序中,测序产量统计的Total Clean Nucleotides对照组平均是473×107nt,低盐度处理组平均是456×107nt。拼接获得了100600个单基因序列,在Nr中有60129个Unigene被注释。预测编码蛋白框共计62434个序列。与对照组相比,差异基因占转录组的比例是9.8%。通过Nr注释,发现目前与大银鱼亲缘关系较近的物种包括是罗非鱼、斑马鱼和青鳉等。2.首次获得大银鱼胚胎盐调节相关靶基因注释信息,且经Real-Time PCR实验对部分靶基因进行了验证。结果显示,盐处理可使大银鱼胚胎NKA (P<0.01)、NKCC、 AQP8、Hsp70显著上升(P<0.05),分别升高了4.6倍、3.7倍、4.3倍和3.1倍;使Kir显著下降(P<0.05),下降了39%。其他与盐渗透调节有关的基因有相应变化趋势。[结论]此次实验结果表明,在一定盐度水环境处理下,可使大银鱼胚胎有关渗透适应的众多转录本表达水平发生显著改变,包括影响Na+离子通道,H+离子通道,K+离子通道等,这些变化可能参与了胚胎的渗透调节,部分构成了大银鱼广盐适应性的分子基础。同时发现在现有的基因组数据库中,大银鱼基因序列中与罗非鱼相关的基因所占比例最高为33.6%,相对于其它物种两者间可能存在较大的亲缘关系。
其他文献
当前我国已总体步入“以工促农、以城带乡”的新阶段,社会主义新农村建设是新时期我国克服发展短板的战略选择,也是实现城乡统筹发展的必然要求。新农村建设模式是农村建设过
瑞典科学家O’Regan和Gratze11991年利用在多孔纳米结构Ti02电极材料上,涂覆适当有机染料作为光的敏化剂,成功制备出效率为7.1%的染料敏化太阳能电池。此后,尽管大量人员投入
本文主要探讨中医英汉平行语料库研发的一系列理论问题。作者回顾国内外双语语料库的开发,从世界英语、中国英语理论和文化翻译学角度论述建立中医英汉平行语料库的理论依据,
目的:观察腺病毒介导的Slit2及Slit2ShRNA转染缺氧诱导的人视网膜色素上皮细胞(retinal pigment epithelial cells RPE)对人脉络膜微血管内皮细胞(Human choroidal microvascula
在研读小说文本的过程中,我们会获得很多东西。但这些东西并不是全部要在课堂里呈现的。学生已经能阅读并理解出来的东西,应该没必要重复。我们要做的是把小说“最该读的内容
目的对武汉市饮用水中有机污染物含量进行调查和风险评估。方法 2013年至2017年,采集武汉市中心城区市政出厂水48件,测定《生活饮用水卫生标准》(GB5749-2006)规定的51种有机污
目的优化酒萸肉炮制工艺,为酒萸肉的炮制工艺标准化提供参考。方法以酒萸肉炮制时的蒸制时间,闷润时间为考查因素,用正交试验设计L(9 34)安排试验,以熊果酸含量、马钱素含量
本文介绍和讨论了关联理论对话语理解规则的解释 ,重点评述了消除规则和引导规则。Sperber和Wilson(1986 1995 2 0 0 1)认为 ,人类之所以有能力实施自发性论证推理 ,是因为
将 177例妇女更年期综合征患者随机分为治疗组 118例、对照组 5 9例 ,治疗组以二仙汤合甘麦大枣汤治疗 ,对照组予以更年安片治之 ,疗程均为 1个月。结果 :治疗组与对照组 3个
自我国加入WTO,经济呈现飞跃式发展。不断规范的市场交易行为,日益成熟的各方面技术,为变压器行业提供了发展条件。面对如雨后春笋般成长和发展的变压器制造企业,电力企业的变压