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猪圆环病毒Ⅱ型(PCV2)是可以引起仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)、呼吸道疾病综合征(PRDC)、皮炎与肾病综合征(PNDS)、肉芽肿性肠炎、坏死性淋巴结炎等多种临床症状的一种免疫抑制病毒。PCV2诱发仔猪相关肠炎疾病是PCVAD的临床症状之一,其表现为仔猪腹泻、消瘦、脱水,抗生素治疗无效后死亡；在肠道和相关淋巴结中均能够检出PCV2病原,剖检可发现肠道有组织学的特征性病变。本文针对2013-2014年四川省13市腹泻仔猪群的PCV2感染情况进行了较全面的流行病学调查,主要研究结果如下：1、四川地区腹泻仔猪群PCV2感染率的统计本研究对来自四川省13个地市的腹泻仔猪样品436份运用PCR方法进行检测并分析,结果显示,436份腹泻样品中PCV2阳性样本312份,总阳性率为71.55%。本次所采样本的13市中腹泻仔猪群PCV2阳性率最高的是攀枝花市为88.89%,最低的是德阳市阳性率为64.51%,同时PCV2与TGEV、PEDV两种仔猪腹泻的相关病毒的混合感染率依次为4.35%、42.88%。1-6周龄腹泻仔猪PCV2核酸阳性率分别为82.88%、86.66%、57.38%、44.11%、45.83%和36.84%。全年四季度采集样本的PCV2核酸阳性率依次为65.78%、66.90%、64.06%、81.52%。各周龄段PCV2阳性腹泻仔猪全血、血清、粪便的总检出率分别为36.67%、30%、83.33%,各组织器官PCV2总检出率由高到低依次为76.92%(腹股沟淋巴结)、71.15%(肠系膜淋巴结)、61.53%(肠)、54.81%(脾脏)、47.11%(肺脏)、29.80%(肝脏)、25%(颌下淋巴结)、14.42%(肾脏)、0(脑)。以上结果表明,腹泻仔猪群内PCV2存在较高的感染率,且除淋巴器官和淋巴组织外,肠道可能为PCV2感染的另一重要靶器官。2、四川地区腹泻仔猪群PCV2分子流行病学调查通过PCR及分子克隆等分子生物学相关技术,对收集的312份PCV2阳性组织病料进行不同基因型PCV2分析。结果显示,PCV2a单独感染占15.12%,PCV2b单独感染率占63.44%,二者混合感染率占21.84%。表明2014年度四川省内腹泻仔猪群不论从单独还是混合感染PCV2b的感染率远大于PCV2a;本试验获得的四川省19株PCV2毒株之间的同源性为94.3%-100%；四川省19株PCV2毒株中16株属于GroupI,3株属于GroupⅡ。19株四川省PCV2毒株间Rep蛋白氨基酸同源性为96.8%-100%,表明Rep基因确属PCV2高度保守序列,变异程度远低于全基因序列。Cap蛋白的核苷酸序列分析结果显示19株四川省PCV2毒株ORF2基因核苷酸同源性为91.3%-99.9%,推导的氨基酸同源性为94.5%-100%。与世界和国内参考株的最大Kimura距离分别为6.09%和4.84%；转换／颠换平均值(R)为0.94和0.68；氨基酸替代倾向指数为3.8%和2.5%。与美国株(FJ218000)相比共有25个氨基酸的突变。Cap蛋白这些位点氨基酸突变的积累效应可能会引起抗原漂移,可能会使PCV2免疫原性的发生改变。