机器学习势方法及其在结构预测与相变模拟中的应用

来源 :吉林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mrlee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基于高性能计算的分子模拟是凝聚态物质研究的重要工具,模拟的关键是准确、高效的势能面计算。第一性原理方法虽然计算精度高、可移植性好,但其计算成本高,难以开展大尺寸、长时间、高通量的模拟;经验势函数方法计算效率高(计算量随体系大小线性增长)可以模拟万原子量级甚至更大的体系,但是模拟精度与可移植性较低。为了兼顾模拟的精度、可移植性与计算效率,本文编写了基于机器学习方法的原子间相互作用势函数程序。在此基础上,将编写的机器学习势程序分别应用于结构预测和重构型固-固相变模拟中,获得了以下创新性研究成果:1.本文将稀疏化的高斯过程回归与改进的原子中心对称函数相结合,自主编写了能够兼顾模拟精度、可移植性与计算效率的机器学习势程序。对硼团簇体系的测试表明,该机器学习势可以高效、可靠重构凝聚态体系的势能面,是加速分子模拟的理想工具。2.第一性原理结构预测需要进行海量结构的能量计算,难以高效地用于大体系的结构研究。本文将机器学习势与CALYPSO方法相结合,发展了机器学习势加速的自适应理论结构预测方法。该方法通过少量结构训练初始机器学习势,并在结构预测过程中通过自适应策略收集外插结构,并对其进行第一性原理计算,逐步完善数据集与机器学习势,同时加速结构预测。利用B84团簇对该方法进行了系统测试,获得了截止目前,能量最低的核壳状B84团簇结构,预测效率较第一性原理结构预测提高了 2个数量级以上。3.第一性原理分子动力学方法难以高效地开展大尺度、长时间的重构型固-固相变模拟。本文采用机器学习势加速势能面计算,并利用元动力学方法加速相变过程,发展了高效、可靠的重构型固-固相变的模拟方法。使用该方法模拟了包含4096个氮化镓原子的晶胞在静水压、额外单轴应力与额外剪切应力作用下由纤锌矿向岩盐结构的相变过程,模拟结果揭示了前人未曾观察到的相变细节,比如形核、生长过程和外界应力条件对相变路径的影响。这些新结果为理解重构型固-固相变提供了新的视角,同时证明了元动力学模拟结合机器学习势是开展重构型固-固相变研究的有力工具。
其他文献
2021年的芝加哥建筑双年展在9月中旬如约而至,以"建筑和设计与健康、可持续、公平和种族正义等关键问题的交集"来展开话题——"可利用的城市"(The Available City)。作为北美最大的建筑及设计展览之一,它不仅为建筑设计师提供了国际化的交流创新平台,还希望通过特展和公共活动结合的方式吸引大众。
期刊
自从仲崇信老先生引入互花米草的三种生态型F-型、G-型和N-型后,国内学者们对于互花米草的研究从未中断,研究主要围绕互花米草的形态学、生态型、入侵机制、生态效应及控制方法等方面展开。我们的研究回答了以下几个问题:中国沿海是否存在这三种生态型杂交和生态型混合;中国沿海互花米草种群内和种群间遗传多样性和遗传结构特征;硫在互花米草入侵过程中是否扮演重要作用。结果表明:(1)我们在中国沿海检测出这三种生态
目的:本研究旨在确定食管癌切除术后吻合口瘘的危险因素,并建立一个预测模型——列线图,以评估食管癌切除术后吻合瘘的发生风险,为临床决策提供帮助。方法:回顾性收集青岛大学附属医院2018年1月至2020年6月患食管癌并接受根治性手术治疗患者的临床资料。使用食管并发症共识小组(Esophagectomy Complications Consensus Group,ECCG)标准定义对吻合口瘘进行定义和分
生物入侵俨然对城市生态系统造成严重的危害和损失,为探究环境因子与入侵植物喜旱莲子草生存、生长的耦合关系,以城市湖泊武汉沙湖的喜旱莲子草种群为研究对象,采用Spearman秩相关检验和非参数性检验分析喜旱莲子草多度、盖度、高度和重要值与岸线环境的相关性和差异性.结果表明:自然条件中,水分生态型对喜旱莲子草的高度影响显著,并与多度(r=0.29)和高度(r=0.44)呈正相关.湖岸沉积物对喜旱莲子草盖
【目的】探讨入侵植物空心莲子草Alternantheraphiloxeroides与其共存本土同属种莲子草Alternanthera sessilis的元素化学计量比差异及环境驱动力,明晰其资源分配格局与营养策略。【方法】在广西自治区、广东、江西和河南省等地区的野外生境中设置6个莲子草-空心莲子草共存群落样地和7个莲子草单生群落样地,分别测定这2种植物的w(C)、w(N)、w(P)及其化学计量比(
葛兰西是马克思主义发展史上一位明星般的人物,这源于他跌宕起伏的人生经历、坚定的革命意志和对无产阶级革命的深邃的反思。葛兰西兼具革命家和理论家的双重身份,这既赋予了他革命策略的深刻性,又赋予了他革命理论的实践性。而这两种特征都在他最具特色的文化领导权思想中明显地表现出来。改革开放以来,国内学界对于葛兰西的研究逐渐升温,文化领导权思想作为葛兰西思想中最核心的部分,无可争议地成为了学者们关注的重点问题,
天然气水合物能量密度大、分布范围广、清洁无污染、储量丰富,被认为是21世纪最具开发潜能的新型战略能源。但与常规的油气藏不同,在开采过程中天然气水合物发生分解会引起储层变形和强度的降低,导致开采井系统失稳,诱发工程地质灾害。我国南海水合物储层以泥质粉砂型水合物储层为主,矿物成分主要由碎屑矿物石英和黏土矿物蒙脱石、伊利石组成。水合物储层非均质性强,矿物成分及含量随站位发生改变,特别是黏土矿物的变化会导
本文主要研究了整数值线性自回归过程、门限整数值自回归过程以及随机系数自回归过程的建模和参数估计问题.首先,对于整数值线性自回归(integer-valued autoregressive,INAR)过程,我们采用分位回归方法给出过程的参数估计,讨论了估计量的渐近性质.利用数值模拟验证了估计方法的有效性与稳健性.并将其应用于失业人口数据中,进一步验证了估计方法的可靠性.其次,基于二项稀疏算子和负二项
地震灾害严重威胁人民生命财产安全。由于地震的小概率性,孕震机制的复杂性及地球深部观测的技术局限性,地震预测预报成为一个需要长期探索研究的世界性难题。经过数十年的观测技术发展,我国已累积了丰富的形变、地球物理和地球化学学科的观测资料,为地震前兆研究提供数据基础。如何在大量观测资料中排除环境干扰等原因引起的异常,提取与地震相关的震前异常具有重大社会需求和深远的科学意义。地震是地下岩层受到集中应力超过强