利用SRAP构建多花黑麦草遗传图谱及重要农艺性状的QTL分析

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多花黑麦草(LoliummultiforumL.)是一种在世界范围内广泛种植的冷季型牧草,具有生长迅速、茎叶丰富、适口性好和品质优良等特性。多花黑麦草在畜牧业中的重要地位使其在我国得以大面积种植,但是目前我国多花黑麦草品种多依赖于进口,培育出适合在国内生产推广并具有更高产量和更好品质的多花黑麦草成为育种工作的目标。构建多花黑麦草遗传图谱可以对重要的农艺性状进行定位,为进一步的基因定位和克隆提供基础,提高多花黑麦草选育的准确性。本试验通过对来源较远和表型差异显著的不同亲本进行杂交,利用SRAP分子标记进行基因分型并构建多花黑麦草遗传图谱,测定田间性状对表型分型。将基因型和表型数据相结合进行QTL定位分析,以期得到育种目标性状的信息为多花黑麦草的育种工作和农业推广奠定基础。1、本试验使用SRAP分子标记构建多花黑麦草遗传图谱。一共筛选出87对条带清晰和重复性好的SRAP引物组合,利用这些标记对亲本及165份F1群体进行基因分型。87对SRAP引物组合一共扩增出314个位点,每对引物平均能扩增3.6个位点,扩增数范围为:1-11,。亲本基因型符合<1m×11>模式的位点一共184个,167个位点被用于母本遗传图谱的构建;亲本基因型符合模式的位点一共130个,112个位点被用于父本遗传图谱的构建。母本遗传图谱全长为762.10cM,标记总数为167,平均图距为4.74cM,每个连锁群长度平均为108.87 cM,最长的连锁群为LG6,长度为141.57 cM,最短的为LG7,长度为84.16 cM。父本遗传连锁图全长为605.76 cM,标记总数为112,平均图距为5.88cM,每个连锁群长度平均为86.54cM,连锁群长度变化范围为64.04~112.51cM,最长的连锁群为LG2,最短的连锁群为LG6。母本与父本遗传图谱的标记密度均达到QTL定位分析要求。2、2015年测量发现多花黑麦草亲本的株高、叶长、叶宽、叶绿素含量和抽穗期性状均表现出显著差异,具体表现为父本“PI370676-1”株高均值比母本“PI266111-1”株高均值高25.68cm,父本“PI370676-1”叶长均值比母本“PI266111-1”叶长均值长6.71 cm,父本叶宽均值宽于母本叶宽均值3.35 mm,母本叶绿素含量高于父本10.31,父本的抽穗期相较于母本晚21 d。杂交F1代群体中5个性状内部呈现很大的变异范围,频率呈正态分布。叶长、叶宽和叶绿素含量中均出现明显的超亲分离现象。利用母本与父本构建的遗传图谱,定位到株高、叶长、叶宽、叶绿素含量和抽穗期的QTL区间一共12个,定位在母本连锁群上的QTL 一共有7个,定位在父本连锁群上的QTL有5个。分别检测到3个与株高相关的QTL区间,2个与叶长相关的QTL区间,1个与叶宽相关的QTL区间,2个与叶绿素含量相关的QTL位点,4个与抽穗期相关的QTL区间。并在母本连锁群1与父本连锁群4上发现株高的显著QTL,在父本的连锁群4上发现叶长的显著QTL,在父本的连锁群6上发现叶绿素含量的显著QTL,在母本连锁群4和连锁群5上发现抽穗期的显著QTL。尽管这些QTL区间的准确性还有待进一步验证,但此工作也能为今后多花黑麦草目标性状的选育提供参考和帮助。
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