始于20世纪70年代的生物制氢,至今40年间,已有丰富的理论,在众多学者的共同努力下研制出利用城市污水、糖厂废水等含碳水化合物较高的物质制取氢气的生物制氢反应器。但利用混合底物制氢的研究不多见。本文以CSTR反应器和UASB反应器为基础,利用红糖废水为生物制氢底物,研究其启动过程中的一些参数调控措施,及在运行稳定后,分析比较两反应器处理红糖和大豆蛋白废水混合底物的处理效果,找到比较适合的混合底物处理反应器。CSTR反应器以较低接种污泥浓度启动,以红糖废水为生物制氢底物,HRT为6h,入水COD浓度分阶段提高到4000mg/L启动成功,稳定运行后入水COD浓度为5400mg/L,最大产气量为18.29L/d,氢气含量达50.87%。UASB反应器同样以红糖为底物,HRT为8h,研究其出水pH低于4.0时的制氢效果。结果表明设定的四个pH条件3.80、3.85、3.94、3.98,比较产气量后,pH为3.94时产气量最大,突破pH4.0为生物制氢的下限值,可减少生物制氢工业化后的成本投加。两反应器对红糖与大豆蛋白混合底物处理效果中,在大致相同的产气量条件下,由于UASB自身可处理高浓度有机废水的特点,其处理混合底物后COD去除率较高；但就系统乙醇型发酵的稳定状况来看,CSTR反应器对混合底物的处理优于UASB反应器。本研究从不同的工程控制参数的调控下探讨CSTR和UASB两反应器进行生物制氢效果分析,并且处理了红糖和大豆蛋白混合底物。但距离工业化大规模生产还有很大距离,应从其稳定性进行更深入的研究。