翼手目中菊头蝠属和鼠耳蝠属核线粒体DNA片段的进化研究

来源 :华东师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:joy197671599
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线粒体DNA转移到细胞核,形成核线粒体DNA(简称NUMTs),这种现象在真核生物中普遍存在。但是,只有少数研究对特定种群进化过程中线粒体DNA向核基因组转移的频率进行评估。本研究以代表菊头蝠属的8个物种为对象,研究线粒体控制区序列转移到核基因组的频率以及相关的转移时间。为此,将获得的线粒体控制区序列和NUMTs合在一起构建系统发育树,结果显示,在菊头蝠属进化过程中,至少有三次独立转移事件,包括两次古老和一次近期转移事件。其中,两次古老的转移事件发生在整个属共同祖先分化之前,形成了NUMT-1和NUMT-2进化分支,这两个进化分支各自包含了几乎所有的研究物种,它们来自线粒体DNA的不同片段,其最近共同祖先时间的估算也早于菊头蝠属的分化时间。第三次转移事件发生在近期,形成了NUMT-3进化支,它只包括菊头蝠中特定类群的物种,其序列与对应的线粒体DNA序列有着更近的亲缘关系。在马铁菊头蝠基因组中进行线粒体DNA的同源搜索,证实了NUMT-1和NUMT-2序列的存在,这也是第一次在蝙蝠的基因组中研究NUMTs。据我们所知,本研究是第一次报道在一个属共同祖先之前线粒体DNA向核基因组转移的频率。随着DNA测序技术的发展,被测序的基因组逐渐增多,越来越多的研究从基因组水平分析NUMTs。但是,到目前为止,从基因组水平对蝙蝠NUMTs进行的研究还是很少。本研究在三种鼠耳蝠(小棕蝠、布氏鼠耳蝠和大卫鼠耳蝠)的基因组中进行BLASTN分析,搜寻线粒体DNA的同源序列(NUMTs)。结果显示,虽然三种鼠耳蝠都来自同一个属,但是在NUMTs总长、数量和分布方面都相差很大。然而,它们三者之间仍有许多同源NUMTs,这些同源NUMTs很可能在它们共同祖先之前就已经转移到核基因组中了。此外,在小棕蝠基因组中发现了一个完整的线粒体基因组NUMT_A,长度为16968 bp,包括所有线粒体基因。本论文通过对一个属多个物种中一个特定线粒体DNA片段的NUMTs,以及一个属少数物种全基因组中所有线粒体DNA片段的NUMTs进行分析,从两个不同层面对蝙蝠中的NUMTs进行了研究。本论文的结果对我们认识线粒体DNA向核基因组转移的机制具有一定的启示作用。
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