冠状病毒为球形或椭球形、有囊膜的单股正链 RNA病毒，属于冠状病毒亚科。冠状病毒可感染人、鼠、猫、猪等哺乳动物，亦可感染鸟等禽类，是造成多种人畜疾病的病原微生物，2003年席卷全球的SARS冠状病毒可导致严重急性呼吸道综合征，引发疫情造成了重大的生命财产损失。2012年，在中东地区发现了新型冠状病毒中东呼吸综合征冠状病毒（HCoV-EMC），病毒可引起患者严重的呼吸道疾病并伴随肾衰竭，死亡率极高，冠状病毒引起了人们的重视。冠状病毒基因组可编码复制酶多蛋白pp1a、pp1ab，这两种蛋白酶切割形成亚基后进而组装形成复制酶复合物，在病毒的转录、复制过程中发挥重要功能。参与切割复制酶多聚蛋白的蛋白水解酶主要为主蛋白酶，该蛋白酶切割位点保守，并且人体中不具有其同源蛋白质，是抗病毒药物设计的理想靶点。　　人冠状病毒NL63（Human coronavirus NL63）与猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus）是两种常见的冠状病毒。人冠状病毒NL63可引发咳嗽、流涕、细支气管炎等呼吸道疾病，猪流行性腹泻病毒是一个高致病的肠道疾病病毒，对全球的猪肉行业造成了巨大的经济损失。　　本研究中，首先我们以人冠状病毒NL63主蛋白酶为研究对象，经过载体构建、蛋白表达纯化在原核表达系统中获得高纯度的主蛋白酶，接下来我们对主蛋白酶与迈克尔受体抑制剂N3的复合物进行结晶筛选与优化，得到适合衍射的单晶，并采用X-射线晶体衍射的方法，收集了分辨率为2.85?的主蛋白酶与抑制剂复合物结构数据，同时测定了抑制剂N3对主蛋白酶的抑制活性。其次我们采用与人冠状病毒NL63主蛋白酶类似的研究方法对PEDV主蛋白酶与抑制剂N3复合物结晶学内容进行了研究，完成了 PEDV主蛋白酶与抑制剂 N3复合物数据收集，分辨率为2.5?。通过对两种冠状病毒与抑制剂复合物的晶体学研究与后续的结构分析，有助于人们了解冠状病毒关键蛋白主蛋白酶发挥作用机制，同时基于结构阐述抑制剂与主蛋白酶相互作用机制，并结合已有研究成果，有利于针对冠状病毒的广谱抑制剂的开发。图21幅，表15个，参考文献62篇。