全球频发的应急事件凸显出当代社会对进一步推进应急管理的迫切需求。在深刻总结国内外历史经验、科学分析全球公共安全形势的基础上,中国共产党和政府审时度势,做出了全面深入加强中国应急管理工作的重大决策。其中,中国共产党十六届三中全会、四中全会、五中全会和六中全会相继提出要“建立健全分类管理、分级负责、条块结合、属地为主的应急管理体制；形成统一指挥、反应灵敏、协调有序、运转高效的应急管理机制”。中国共产党十七大报告中也对进一步建立健全应急管理机制提出了明确的要求。应急管理机制建设管理的重要性在许多重要会议、报告、文件和法规条律中,都得到了明确和强调。2002年后,受规模效益、养殖条件和政策导向等因素的激励,中国规模养殖量占地区畜禽总量的比例,已由1990年代末的15%左右发展到目前的25%左右,少数地区已达40%。2009年,在规模养殖中极具代表性的生猪规模养殖与农户散养的年出栏头数比例,发展为61.3%比38.7%。快速发展的规模养殖业,为养殖企业(农户)带来了比种植业更多更快的经济效益,但粗放式经营模式伴随而来的还有养殖疫病的大规模爆发。这类疫病的爆发规律由原来的周期性、季节性、阶段性、单一性发展成为随气候、温湿度变化而变化的无季节性和骤发性、疫病发作反复性、疫病交叉变异性。疫情规模由局部发展成区域,甚或侵及全球。这种发展趋势既严重损害了养殖企业(农户)的经济利益,也把食品安全问题挂在了公众的忧虑之中,而且通过市场供给的不良影响对我国市场经济的健康发展带来了不稳定因素。这一切都使得规模养殖疫情应急形势变得愈发严峻。如何从实际出发,充分借鉴吸收国内外应急管理机制先进理念和技术,以及相关理论和方法,全面有效地分析出规模养殖疫情产生的原因和路径,针对当前规模养殖的实际重点问题,采取切实有效手段,从疫病爆发和蔓延的源头进行防范和治理,这是摆在我们面前一个亟待解决的重要问题。本文以应急管理机制的基础工作建设管理为导向,采用应急管理理论、饱和流理论和混合遗传算法、系统动力学(System Dynamics,简称SD)反馈仿真理论和技术、以及企业社会责任理论,提出应急管理机制创新的五个薄弱环节,坚持“预防和治理相结合,预防为主”的疫情应急应对理念,落实到规模养殖疫情防治中消除食物链污染和环境污染这两个重要方向开展研究,并以江西银河杜仲绿色规模养殖区域为研究案例进行理论和实际相结合。本文主要研究成果如下：1.对规模养殖疫情应急管理机制的创新方向进行了研究。从应急管理机制内涵和体系框架的新认识、发达国家应急管理机制的特点和成功举措、我国规模养殖疫情应急现况及应急建管矛盾、以及我国应急管理机制薄弱环节建设这四个方面,对规模养殖疫情应急管理机制进行了研究。2.提出了求上下界网络中最小流的高效算法,在此基础上和原提出的求最大流算法相结合,提出了求紧急网络中最小饱和流的混合遗传算法。在建立有上下界网络的最大流与最小流的一一对应关系的基础上,基于有上下界网络最大流最小截算法,给出了求有上下界网络的最小流的高效算法；基于最大流与最大饱和流的等价关系,给出了求紧急网络的最大饱和流的高效算法；基于稳态遗传算法作框架、有上下界网络的最小流算法做解码器,给出了求紧急网络的最小饱和流的混合遗传算法。该混合遗传算法,利用了最小饱和流问题的特殊网络结构,在编程实现、计算时间、计算所需内存、以及全局寻优能力等方面有好的性能,是求解最小饱和流问题的稳健有效方法。3.利用最大流和最小饱和流混合遗传算法,从实际需求出发,对大规模沼液处理流程进行了三层目标轮换六级储存净化网络设计,为高效经济的解决大型沼气工程所形成的沼液二次污染问题提供了一种便利可行的方法。利用已提出的最大流和最小饱和流网络算法,结合生态系统管理的理念,以江西银河杜仲绿色规模养殖基地二次污染问题为实证研究对象,对该基地沼气工程所产沼液的沼液分流、延迟过滤、自然流好氧、储存输送工艺流程,依据实际地理地形,进行了三层目标轮换六级储存的网络设计。这个网络流程设计在治理大规模沼液二次污染问题上,对工艺流程设计决策的科学合理作出了重要保障,有利于高效经济地实现大型沼气工程区域内沼液零污染最小排放量的核定,为更好地解决大中型规模养殖的沼液二次污染问题提供了一个新的分析方法。4.提出了反馈调控参数入树逐步建模法,用此方法进行了SD动态反馈仿真分析,从定量角度对开发利用规模养殖液态生物质资源有利于污染防治和绿色食品原料供给进行了有效分析和论证。以银河杜仲公司规模养殖所产的猪尿与冲栏水共同构成的液态生物质资源开发利用为研究对象,采用了反馈调控参数入树逐步建模法,通过把调控参数设置为常数,逐步建立了液态生物质资源开发利用系统中的7个流位变量(日均存栏数、年猪尿量、场猪尿年产沼气量、场猪尿沼气可发电量、年开发猪尿沼液中的所含的氮、磷、钾量)的流率基本入树模型,并逐一进行初步仿真；然后通过反馈调控参数函数模型,建立这7棵入树的反馈结构仿真模型,继而再进行综合仿真；根据仿真结果和反馈结构图,提出了3条相应的管理对策。5.通过SD演化博弈分析框架,对有限理性条件下、人参与的环境污染防治系统进行了复杂系统主导结构、环境污染治理随机稳定状态和环境污染防治策略矩阵等的刻画和分析,并提出了实践环保责任的政策建议。在辨析农业企业社会责任涵义、特点和存在的问题的基础上,以银河杜仲公司及所在区域为研究对象,从我国农业企业当前和今后较长时期内的一个主要社会责任----环境污染防治角度入手,通过SD演化博弈分析框架对以政府、农业企业和公众为主体的疫情防治环境保护系统进行了系统主导结构刻画分析,定义了环境污染治理的随机稳定状态,并对环境污染防治进行了策略矩阵分析,从而提出了以政府、农企和公众为主要责任主体共同实践环保责任的政策建议。6.依托前述方法和研究结果,围绕规模养殖疫情预防治理的两个重要方向开展研究。为了夯实应急管理机制工作的基础,着重化解当前规模养殖疫情困境,从两个重要方向开展研究：(1)消除环境污染。以开发猪尿与冲栏水共同构成的液态生物质资源,建立多级储存净化网络,促进多渠道资源开发。并结合银河杜仲公司这个实际案例,进行了杜仲猪用饲料种植生产饲养的SWOT分析、银河杜仲沼气发电成功案例分析、以及沼液多级延迟净化输送网络的实证分析和阐述。(2)消除食物链源头污染。开发本地特色资源种植生产无污染饲料,消除食物链源头污染。