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羊绒细度是评价羊绒品质和衡量羊绒价格的关键,其表型特征的本质由基因表达决定。近年来,非编码RNA(nc RNA)与羊绒有关的研究越来越多。但有关环状RNA(CircRNA)与羊绒细度调节的研究却很有限。CircRNA是具有共价闭合环状结构的内源性非编码RNA(nc RNA)。CircRNA具有独特的圆形结构,比m RNA更稳定,半衰期更长。因为CircRNA是闭合环状结构所以在大多数真核生物和非常稳定。我们采集了辽宁绒山羊(LCG)和内蒙绒山羊(MCG)的皮肤样品。对不同表达CircRNA进行RNA测序,分析样本后进行鉴定与MCG皮肤相比,LCG中有17个上调的CircRNA和15个下调的CircRNA。为了寻找LCG中差异表达的CircRNA,我们对10个CircRNA进行了qpcr验证,四个circ RNAs:ci RNA128、circ RNA6854、CircRNA4154、CircRNA3620在辽宁绒山羊中高表达。此外,CircRNA-mirna的调控网络具有生物信息性推测并可能有助于理解潜在CircRNA参与的分子机制调节羊绒细度。获得的结果如下:1.羊绒细度相关CircRNA测序结果分析本研究通过对辽宁绒山羊和内蒙古绒山羊皮肤组织RNA-seq中总共鉴定到13,320个circ RNA,其中包括610个intronic RNA(ci RNAs)。在LCG和MCG文库中分别检测到7531和8943个CircRNA。LCG和MCG中CircRNA的数量在200～400 bp之间最多,大部分CircRNA含有2～7个外显子。我们使用q PCR证实了circ RNA在粗型和细型LCG皮肤中的差异表达。RNA-seq结果显示,在上调的circ RNA中,ci RNA128的表达水平最高,而在下调的circ RNA中,circ RNA6854的表达水平最高。ci RNA128,circ RNA6854,circ RNA3620和circ RNA4154的结果在RNA-seq和q PCR中表达差异显着,这表明它们可能在具有不同纤维直径的羊绒山羊中发挥积极作用。同时我们发现了高表达的宿主基因TCHH。2.羊绒细度关键基因TCHH的ceRNA调控网络我们通过对TCHH基因进行ceRNA预测得到网络调控图。TCHH基因为5个mi RNAs的靶基因。随后我们对5个mi RNAs进行荧光定量PCR检测。结果表明mir-126在辽宁绒山羊细型中高表达;MSTRG-5429.1在辽宁绒山羊粗型中高表达,可能对辽宁绒山羊的羊绒品质起正调控作用。3.TCHH基因SNP检测及其与羊绒细度相关性分析:为了更近一步了解TCHH基因对羊绒产量和细度影响。我们对300只辽宁绒山羊的血样进行采集测序,在TCHH基因外显子上共筛选出4个SNP变异位点,其中G112A,G287T,A555G突变共产生三种基因型,A585T突变产生俩种基因型。对相关数据分析发现G112A,G287T,A585T位点的基因型突变对产绒量有着负调控的作用,产绒量都有着不同程度的下降,A555G位点的GG基因型突变对绒山羊的产绒量有着显著提升(4.5%)。