普通小麦SPL13基因的分离与多态性分析

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小麦作为世界上种植面积最广、总产量最高的三大粮食作物之一,其产量的提高一直以来是世界各国农学科研工作者的研究重心。普通小麦(Triticum aestivum L.)是经过长期演变而来的异源六倍体,普通小麦基因组测序草图的公布,为小麦重要农艺性状相关基因的克隆与功能分析奠定了基础。SQUAMOSA promoter bingding protein-like(SPL)基因家族是一个功能多样的转录因子家族,在高等植物的生长发育过程中有着重要作用,但小麦中关于SPL基因的研究还比较少。本研究分析了普通小麦中国春(Chinese Spring,CS)SPL基因家族的序列、结构及进化关系,并在10个籽粒大小不同的六倍体小麦品种中克隆了TaSPL13基因,对其基因序列、蛋白结构域和基因多态性等进行了分析。主要研究结果如下:(1)以水稻SPL的SBP结构域为模板,通过BLAST分析,我们在中国春中共发现了44个SPL基因。系统进化分析表明,除TaSPL3和TaSPL12这两个基因存在分化外,其它的SPL基因在进化上都非常保守。中国春中有16个SPL基因具有miR156靶位点,这些基因可能受miR156调控,预示着这些基因在小麦生长发育过程中可能起着重要作用。从基因结构分析结果中可以看出,中国春中筛选出的44个基因与其在水稻中对应的同源基因的基因结构差异不大,基因结构非常保守。(2)根据在中国春中的分析结果,我们设计了不区分A、B、D染色体组的SPL13引物,选取10个籽粒大小不同的六倍体小麦品种,从中共随机分离出了38个具有差异的SPL13基因。(3)发现这38个SPL13基因全部都具有miR156靶位点,且miR156靶位点都分布在SPL13基因下游的外显子上。这些基因的序列比对结果显示有5个来自中小粒小麦品种的基因与其它33个SPL13基因存在较大差异;不仅如此,这5个基因在SBP结构域和系统进化关系上也与其它基因不同。同时我们在统计普通小麦SPL13基因突变时发现,中、小粒小麦SPL13基因的突变频率远远高于大粒小麦,推测小麦的籽粒大小与SPL13的突变程度有关。综上所述,我们较全面的分析了中国春中的的SPL基因家族,并从不同籽粒大小的六倍体小麦中分离了SPL13基因。我们的工作表明,SPL13基因在不同籽粒大小的六倍体小麦中存在差异,但这些差异对小麦籽粒大小的影响还需进一步研究。
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