随着“大众创业,万众创新”的热潮不断升级,科技企业孵化器逐渐成为社会关注的焦点,对科技企业孵化器商业模式的研究也越来越被重视。为了解决科技企业孵化器的可持续发展问题,对其管理不能仅仅停留在运营层面,需要上升到整个商业模式的高度。2017年,XY科技企业孵化器与所在开发区管委会的联建协议到期,针对运营以来未实现自身盈利、与区域产业经济结合不紧密、内部团队管理及公共服务水平整体欠缺的情况,管委会对XY科技企业孵化器提出了更高的建设要求。本文以科技企业孵化器的商业模式和价值链为基础,参考国内外研究成果,探索构建科技企业孵化器商业模式的相关理论,明确其现实意义上的价值流向。从XY科技企业孵化器商业模式的形成过程出发,同孵化器商业模式模型相结合,对其目前综合服务模式各要素进行了深入的分析。针对XY孵化器当前所面临的问题,本文借鉴了国内其他发展趋势良好的孵化器商业模式的经验和做法,提出了打造生态驱动型商业模式、构建全产业链服务的差异化战略的建议,通过重新定位目标客户群、强化投融资服务功能、优化组织架构和收入组成的具体措施来进行商业模式优化,并且对新的商业模式内外部保障措施都提出了具体的建议。