沙门氏菌诱导家蝇幼虫SSH文库构建及差异表达基因分析

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家蝇抗菌肽是一类具有抗菌活性的黏性小分子多肽,其具有的特殊性质使其成为各种生物体先天免疫防御系统的重要组分。家蝇在病菌杂生的环境中,能够表现出超强的适应生存能力,这是因为其自身具有较为完善的先天免疫系统,并形成了特殊抵御外来有害微生物侵入的防御机制,因此,家蝇抗菌肽的研究已成为当前的热点和新方向,随着家蝇抗菌肽基因结构和功能研究的深入,人们认识到这些基因结构和功能应是基因差异表达的结果,为进一步揭示不同类型个体间基因的表达规律。本研究选取了相伺日龄、同一饲养条件下的家蝇幼虫,以三日龄家蝇幼虫为材料,利用抑制消减杂交技术构建了沙门氏菌诱导和未诱导的消减cDNA文库,并进行差异表达基因克隆,同时结合PCR技术和反Northern点杂交对抗性差异表达基因进行筛选;最后利用5’RACE和3’RACE钓取沙门氏菌诱导产生的家蝇防御素、攻击素的差异cDNA片段的全长基因,将获得的全长基因进行具体功能分析。现将本实验所得结果列下:(1)利用抑制消减杂交技术构建正向和反向抑制消减杂交文库。以沙门氏菌诱导家蝇幼虫为Tester、正常家蝇幼虫为Driver分别构建消减cDNA文库。正向与反向抑制消减杂交文库中分别随机挑选500个克隆经PCR鉴定,消减文库的单克隆重组率分别为92%和91%,差异基因片段大小为0.2kb-1.0kb。(2)利用正向和反向消减cDNA二次PCR扩增产物作探针,对两消减cDNA文库中的阳性克隆进行高通量筛选。在以沙门氏菌诱导家蝇幼虫为Tester、正常家蝇幼虫为Driver的消减cDNA文库中,选取194个差异表达克隆进行测序及同源性比较分析,筛选出30个与家蝇抗菌肽基因有同源性的序列,27个为未知序列,137个与其它相关基因有高同源性。在以正常家蝇幼虫为Tesetr、沙门氏菌诱导家蝇幼虫为Driver的消减cDNA文库中,选取71个单一有效cDNA序列进行分析,筛选出66个与家蝇基因有同源性的序列,5个为未知序列。(3)利用SMARTTMcDNA末端快速扩增技术,成功克隆了3个家蝇幼虫差异表达全长基因:defensinIcDNA全长489bp, ORF为282bp; defensinⅡcDNA全长474bp, ORF为276bp; attacincDNA全长883bp, ORF为719bp。(4)利用CLUSTALW等软件对家蝇幼虫defensinⅠ、defensinⅡ及attacin基因所编码的蛋白质结构与功能等特征进行了预测和分析。家蝇抗菌肽基因defensin与报道的家蝇、丝光绿蝇、厩蜇蝇的同源性比较高,与黑腹果蝇、Eristalis tenax defensin蛋白同源性较低,该编码蛋白在氨基酸水平上具有很高的保守性。attacin基因与果蝇、刺舌蝇、Harmonia a xyridis、家蚕、丝光绿蝇及绿棉铃虫基因编码的氨基酸与其它的双翅目昆虫的attacin相似性较低。
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