我国自开始实行“大部制”改革以来,大部制在许多地方落地生根,开花结果,并在发展中不断创新。其中,最典型的当数2009年深圳市的“行政三分制”改革。作为大部制改革的一种大胆的创新与突破,“行政三分制”改革在深圳市取得了一定的成效。比如,加快了深圳市政府职能转变的步伐,提高了深圳市政府的行政效率,提升了深圳市政府的廉洁度,等等。然而,在深圳市“行政三分制”改革一路高歌之际,我们也发现,改革所暴露出来的困境亟需我们去改善。这些困境,包括改革推进缓慢,机构改革不全面;监督机制不合理,改革基础不牢固;配套法规制度不健全,改革缺乏足够保障;政府与民互动不足,善治理念彰显不够,等等。然而,学术界就深圳市的“行政三分制”改革(特别是在配套改革与内部协调方面)所作专门、深入研究的成果并不多见。本文认为,第一,深圳市“行政三分制”全面改革具有应然性与必然性;第二,完善监督机制是深圳市“行政三分制”改革顺利推进的基础;第三,深圳市“行政三分制”改革必须强化“与民互动”的善治理念;第四,配套制度完善是改革顺利推进的保障;第五,增强内部协调能够为改革凝聚人心。笔者在这五方面做了大量的努力,希望能够为进一步深化深圳市“行政三分制”改革献言献策,提出一些大胆的想法,比如进一步健全公务员退出机制,建立并完善官员廉政保证金制度,制定并完善行政程序法规,设立内部协调中心,建立健全内部辩论式听证制度,等等。本文采用文献分析法、实证分析法、归纳演绎法等多种研究方法,首先对“行政三分制”改革的理论构想、内涵与实践探索展开探讨,接着就大部制改革的创新实践—深圳市“行政三分制”改革的政治背景、行政背景、经济背景与社会背景进行分析,并对其概况进行总结,然后在此基础上,分析了“行政三分制”改革在深圳市取得的成效及其深层意义,再接着就深圳市“行政三分制”改革的困境进行客观的解析,最后进行了一番深入的思考,提出了具有针对性的对策。