污染型环境犯罪案件的复杂性、污染行为的多样性、污染结果的长期潜伏性等特点,导致运用传统因果关系理论去认定污染型环境犯罪的因果关系存在较大困难。究竟适用何种理论学说对污染型环境犯罪因果关系进行认定,学界目前尚无定论,讨论较多的当属疫学因果关系理论,间接反证理论、因果关系推定理论等学说,其中,因果关系推定理论由于吸收了疫学因果关系与间接反证理论的优势成为较为有效的认定污染性环境犯罪因果关系的理论。本文通过对传统刑法因果关系的梳理,借鉴国内外对该问题的优秀研究成果,提出采用因果关系推定理论解决污染型环境犯罪因果关系认定困难这一难题。具体来讲,本文分为四个部分:第一部分主要介绍了污染型环境犯罪的基本概念,国外对污染型环境犯罪因果关系的认定研究,我国对于该问题的研究现状等基本问题。第二部分主要论述了当前污染型环境犯罪因果关系认定存在的难题及原因分析,污染型环境犯罪因果关系的认定存在目前有两个难点,难以达到普通刑事案件的证明标准,控方承担所有的证明责任存在困难;而产生这两个困难的原因是由于污染型环境犯罪自身的特殊性以及传统刑法因果关系理论无法合理认定污染型环境犯罪的因果关系。第三部分主要介绍了污染型环境犯罪因果关系认定讨论较多的三个理论。包括疫学因果关系理论,间接反证理论,因果关系推定理论,并对这三个理论的优势与缺陷进行分析。第四部分是本文的重点,论述了因果关系推定理论解决污染型环境犯罪因果关系认定的合理性与可行性;同时,对适用因果关系推定原则提出了原则性的限制,即必须符合必要性、合理性原则。最后,在具体适用过程中必须遵循具体的适用规则。