梨花芽休眠期间NCED、CYP707A基因的克隆与表达分析

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:feng211314
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
梨(Pyrus L.)是蔷薇科(Rosaceae)落叶植物,梨花芽会在冬季进入休眠以适应外界不良环境,并需经历一定有效低温方可萌动。ABA是促进休眠深化、抑制休眠解除的重要物质,其含量变化主要受其合成、分解代谢的调控。本试验以‘黄花梨’、‘蜜雪梨’为试材,分析需冷量不同梨品种花芽休眠期间ABA的变化,及ABA合成、分解途径关键酶基因(PpNCEDs、PpCYP707As)的特性,主要结果如下:1梨花芽休眠期间ABA含量的变化运用HPLC测定‘黄花梨’、‘蜜雪梨’花芽休眠过程中ABA含量的变化。休眠期间‘黄花梨’、‘蜜雪梨’花芽内ABA含量变化趋势相似,呈波浪形变化,‘黄花梨’有4次ABA含量变化高峰,‘蜜雪梨’有3次;‘蜜雪梨’花芽内ABA的含量高于‘黄花梨’;‘黄花梨’、‘蜜雪梨’花芽内ABA含量在休眠解除前同为下降,在休眠解除过程中分别为增加和先增后降,在休眠解除后又同为增加。试验结果表明,需冷量不同梨品种花芽休眠期间ABA含量的变化有差异,ABA含量下降是梨花芽休眠解除的必要条件之一,ABA还可能参与梨对低温的应答,单一ABA含量变化趋势不能作为梨花芽休眠进程的判断依据。2梨PpNCEDs、PpCYP707As的生物信息学特点参照NCBI上蔷薇科ABA代谢途径关键酶基因NCED、CYP707A的序列,采用本地blast的方法,从梨基因组数据中搜索到梨NCED、CYP707A的CDS序列,并从‘黄花梨’、‘蜜雪梨’上均克隆到3个NCED基因,命名为PpNCED1、PpNCED2、PpNCED3,已登录NCBI;均克隆到5个CYP707A基因,命名为PpCYP707A1、PpCYP707A2、PpCYP707A3、PpCYP707A4、PpCYP707A5,已登录NCBI。‘黄花梨’与‘蜜雪梨’PpNCEDs、PpCYP707As基因序列的相似度较高,在蔷薇科植物的同源基因系统进化树上,‘黄花梨’、‘蜜雪梨’、‘酥梨’(梨基因组)的相关基因优先聚类,再与苹果相应基因聚类,同植物学分类关系一致。PpCYP707A家族的PpCYP707A4、PpCYP707A5相似度极高,分别与苹果的两个基因(XP008346457.1、XP008382035.1)单独聚类,而非PpCYP707A4和PpCYP707A5独自聚类,它们的生物学信息较为接近,可能产生于梨和苹果的共同祖先,且保守性很强。运用生物信息学方法分析‘黄花梨’PpNCEDs、PpCYP707As编码蛋白性质。PpNCEDs蛋白含有 1 个保守结构域,为PLNO2258;PpNCED1、PpNCED2、PpNCED3蛋白的氨基酸组成数量分别为617、613、607,均为不稳定、亲水蛋白。PpCYP707As蛋白含有1个保守结构域,为PLN02196;PpCYP707A1、PpCYP707A2、PpCYP707A3、PpCYP707A4、PpCYP707A5蛋白的氨基酸组成数量分别为452、451、479、476、474,PpCYP707A1蛋白属稳定、亲水蛋白,其余4个PpCYP707As蛋白均为不稳定、亲水蛋白。氨基酸组成数量、含量的不同决定了PpNCEDs、PpCYP707As各成员的蛋白质理化性质、亚细胞定位、跨膜结构、磷酸化修饰、蛋白卷曲螺旋结构、二级结构、三维结构等方面信息均不同。3梨花芽休眠期间PpNCEDs、PpCYP707As的表达分析运用荧光定量PCR测定了休眠期间‘黄花梨’、‘蜜雪梨’花芽内PpNCEDs、PpCYP707As的相对表达量。‘黄花梨’、‘蜜雪梨’花芽休眠期间PpNCEDs、PpCYP707As各基因的表达量变化趋势均呈波浪形变化,但不完全相同。2012、2013两年秋冬休眠期,‘黄花梨’花芽内PpNCEDs、PpCYP707As的表达量变化趋势均与ABA含量相似,但各基因表达量高峰的时间点不一致。‘蜜雪梨’花芽内仅PpNCED1、PpCYP707A3的表达量变化趋势同ABA含较为相似,但表达高峰时间点不同于ABA含量高峰;PpNCED2、PpCYP707A1、PpCYP707A2的表达量变化趋势仅在花芽萌动期与ABA一致;而PpNCED3的表达变化趋势则不同于ABA。试验结果表明,PpNCEDs与PpCYP707As以一种协调关系共同调控ABA含量;PpCYP707As负反馈调节ABA含量,该负反馈调节存在时空特异性和品种间差异,且PpCYP707As的表达并非完全受制于ABA。寒流来袭导致花芽内ABA含量升高,而PpNCEDs、PpCYP707As的表达量均上调,说明寒流来袭PpNCEDs对ABA含量起主要调节作用。休眠解除临界期前ABA含量下降,‘黄花梨’花芽内PpCYP707A2表达量上调、其他基因表达量下降,‘蜜雪梨’花芽内PpNCEDs、PpCYP707As的表达量同为下降,说明此时‘黄花梨’花芽内PpCYP707A2、‘蜜雪梨’花芽内PpNCEDs对ABA含量起主要调节作用;休眠解除完全期前,‘蜜雪梨’的ABA含量下降,PpCYP707A1、PpCYP707A2的表达量升高、PpNCEDs的表达量均升高、PpCYP707A3的表达量下降,说明此时PpCYP707A1、PpCYP707A2对ABA含量起主要调节作用。短低温梨品种‘蜜雪梨’ABA含量调节机制与花芽休眠机制关系同‘黄花梨’有差异。4梨PpNCEDs和PpCYP707As基因启动子的元件分析从‘黄花梨’上克隆到PpNCED1、PpNCED2、PpNCED3;PpCYP707A1、PpCYP707A2、PpCYP707A3的启动子序列。分析ATG前1500bp启动子区域的作用元件,PpNCEDs、PpCYP707As的启动子区域含ACE、G-Box、AE-box等21类光响应元件,ABRE、GARE、TGA-element等6类激素响应元件及其他6类元件,众多元件中有4类元件可被bZIP类转录因子识别。试验结果表明,PpNCEDs、PpCYP707As的表达可能与光响应调控、激素平衡有关,还受bZIP类转录因子的调控。5PpNCED1、PpCYP707A1、PpCYP707A2 的原核表达采用原核表达体系表达‘黄花梨’的PpNCED1、PpCYP707A1、PpCYP707A2蛋白。以 pEASY-Blunt E1 作为连接载体,构建 pEASY-PpNCED1、pEASY-PpCYP707A1、pEASY-PpCYP707A2等原核表达载体,将表达载体转入BL21(DE3)中,获得表达菌株BL21(DE3)-pEASY-PpNCED1、BL21(DE3)-pEASY-PpCYP707A1、BL21(DE3)-pEASY-PpCYP707A2。1mol/l IPTG 诱导菌株表达 6h 后,进行SDS-PAGE分析,BL21(DE3)-pEASY-PpCYP707A1、BL21(DE3)-pEASY-PpCYP707A2表达出目的蛋白,BL21(DE3)-pEASY-PpNCED1未能表达出目的蛋白。
其他文献
近年来,随着社会经济与科学水平的不断发展,我国的卫生事业经历了长足的发展,特别是基层医疗卫生机构的卫生服务,取得了非常显著的成效,社区卫生服务机构、人员和服务人次(数
为了能选育出产量高、品质好、生长周期短、适应性较广的白灵菇新品种,本试验采用原生质体再生无性系、原生质体紫外诱变育种以及白灵菇与杏鲍菇远缘杂交育种的方法对白灵菇
柳杉(Cryptomeria fortunei Hooibrenk ex Otto et Dietr)作为天目山自古以来一道独特的风景,具有重要的科研价值和生态意义,但随着近年来各方面环境的不断恶化,天目山柳杉受
本研究以千层金叶片为材料,对其抗氧化活性物质展开了较为系统的研究。主要研究内容如下:1 千层金叶片化学成分初步研究采用系统预试法对千层金叶片中化学成分进行检测,初步
目的:探讨肝动脉血流阻断在肝包虫外囊完整剥离术中的应用效果与临床意义。方法:本课题回顾性分析于2016年1月至2019年9月期间在我院住院手术治疗的80例患者资料。手术方式为
SiC材料具有带隙宽度可调、高硬度、高临界击穿电场、高热导率及化学稳定性好等特点,且SiC的介电常数为复函数,在Reststrahlen光谱带内支持耦合光子-声子表面波即表面声子极化子(SPhP),从而在热辐射方面有重要应用。本论文主要研究了基于SiC的一维周期结构和二维周期结构的热辐射特性。论文主要工作如下:(1)分析了单层SiC结构和一维周期SiC-SiO2光子晶体的热辐射特性。研究发现单层S
目的:颈内静脉呼吸变异度指导目标导向液体治疗在老年胃肠道手术中临床应用的效果观察。方法:选择择期行胃肠道手术的老年患者60例,随机分为二组,每组30例。C组液体治疗方案:
化感自毒作用是连作障碍产生的重要原因之一,本实验以‘新银辉’甜瓜品种为材料,通过甜瓜植株浸提液处理甜瓜的种子和幼苗,分析甜瓜化感自毒作用的机理;利用数字基因表达谱测
赋予土地承包经营权抵押权能对构建新型农业经营体系,赋予农民更多财产权利,进而推动城乡一体化建设具有重要意义。现行法律规定的农村土地利用制度已不能满足社会发展的需要
细胞分裂素(cytokinin,CK)是贯穿植物一生的十分重要的信号分子,在植物生长发育的许多方面扮演至关重要的角色,包括胚胎发生,根系的保持和分生组织的出芽以及植物维管的发育