改革开放30多年来，我国经济结构发生了巨大的变化，其中最明显的特点就是民营企业的迅速崛起。目前民营企业已经成为我国经济发展的重要组成部分和经济支柱。随着经济时代的发展，我国民营企业在发展过程中面临一系列的机遇，但同时面临更多的问题，特别是运营管理流程及组织结构的不完善严重阻碍了民营企业的进一步发展。业务流程再造（BPR）是近年来企业界和理论界较关注的新的变革管理思想。它是以业务流程为改造对象和中心，以关心客户的需求和满意度为目标，对传统管理模式下的企业经营业务流程进行根本性的思考与彻底的再设计，以求最优及最低成本满足客户要求。本文以民营医疗设备E公司（简称E公司）为例，以该公司运营流程为研究对象，首先从企业组织结构、流程再造基本理论入手，对组织结构、流程再造相关理论进行了认识，并分别探讨企业组织结构再造及流程再造对现代企业重要作用；接着对E公司当前的组织结构及公司的运营流程进行介绍，并就结构及流程方面存在的问题进行了分析；紧接着基于所存在的问题，进行了流程再造的可行性分析；然后针对弊端进行再造实施方案制定，并进行阶段性评价。