蛋白质组学技术旨在绘制生物样本的蛋白质景观图,它可以应用于各种样本,包括细胞、组织和体液。蛋白质是细胞中的主要功能分子,能准确地反映细胞表型及其内部的调节过程。本文旨在通过高通量蛋白质组学技术筛选乳腺癌患者血清与正常人血清之间差异表达的蛋白质,发现单个候选生物标志物,然后在细胞系中进行生物功能测定,寻找潜在的乳腺癌新蛋白生物标志物,为乳腺癌的筛查、诊断、检测和分期提供临床依据。本实验收集了8个乳腺癌患者血清与3个正常人血清,使用基于质谱的蛋白质组学技术分析乳腺癌血清样本,从而进行乳腺癌血清蛋白质组定量检测。乳腺癌患者血清蛋白与正常人相比Ratio>1.5并且P-value<0.05就是差异表达蛋白质,并对其进行GO、KEGG、亚细胞定位等生物信息学分析。结果显示有8个差异蛋白在乳腺癌患者的血清中表达上调,10个差异蛋白在乳腺癌患者血清中表达下调。乳腺癌患者血清差异表达蛋白主要位于细胞表面作为受体蛋白或者起连接作用,具有信号转导活性及受体活性,参与信号转导的调控与细胞的迁移。乳腺癌患者血清差异表达蛋白主要富集于通路hsa05130致病性大肠杆菌感染(hsa05130 Pathogenic Escherichia coli infection)。差异表达蛋白ITIH2、IGFBP4、FGA、FBN1和TNC之间具有相互作用关系。分析发现表达下调蛋白APOL3和上调蛋白C1RL与癌症发生、发展没有关系,但二者可能参与调节细胞对外来刺激的反应。本文在乳腺上皮细胞MCF-10A中敲低APOL3模拟在乳腺癌细胞中的状况,结果发现敲低APOL3后细胞的增殖、迁移与细胞周期进程无明显变化,说明敲低下调蛋白APOL3对细胞MCF-10A的生物学功能没有明显影响。在乳腺上皮细胞MCF-10A中过表达C1RL后细胞的增殖、迁移与细胞周期进程无明显变化,说明过表达上调蛋白C1RL对细胞MCF-10A的生物学功能没有明显影响。这个结果并不能表明C1RL与APOL3基因与癌症的发生发展无关,因为单一蛋白的含量变化可能不足以改变细胞的增殖与迁移。因此,我们认为APOL3和C1RL等蛋白是潜在的生物标志物,为乳腺癌的筛查和分期诊断提供临床依据。