在农村基层治理场域中,驻村工作队嵌入到农村中,承担着向农村输送资源的职能,村“两委”则利用熟人关系网和语言优势帮助驻村工作队开展工作,二者优势互补,在贯彻落实国家各项政策的同时提高了基层治理和发展的能力。民族地区因语言、地理位置与文化的差异性所导致的特殊性,对驻村工作队与村“两委”的合作提出了更高的要求。然而,在基层治理实践中,二者合作关系协调不畅、合作过程与合作效果不理想等现象仍然存在。驻村工作队和村“两委”作为农村基层治理的重要主体,如何有效促进二者合作成为亟待解决的关键问题。本文以民族地区的驻村工作队与村“两委”的合作为研究对象,综合运用实地考察法、半结构访谈法以及扎根理论、结构方程模型等研究方法。首先,在梳理国内外驻村工作队与村“两委”合作相关文献及理论的基础上,搭建了论文的理论分析框架;其次,选取南疆地区典型区域实地调研,运用扎根理论方法对获得的资料进行开放性编码、主轴性编码和选择性编码,构建了民族地区驻村工作队与村“两委”合作理论模型,并对模型进行了阐述;再次,借鉴扎根理论得出的结果设计了Likert 5点量表问卷,进行问卷调查,对收集的量表数据进行样本特征分析、信效度分析和验证性因子分析,构建了结构方程模型,验证了理论模型的合理性。研究结论显示:（1）内部需求、固有认知、指令规范、过程规范、外部因素和内部因素等正向显著影响合作意愿。内部需求和固有认知是合作意愿产生的源泉,指令规范与过程规范对合作意愿起规范作用,外部因素和内部因素对合作意愿大小起调节作用。（2）合作意愿正向显著影响合作行为,良好的合作意愿能够有效促进合作行为产生。最后,根据研究结论提出优化民族地区驻村工作队与村“两委”的合作态度、加强民族地区驻村工作队和村“两委”的合作规范、改善民族地区驻村工作队与村“两委”的合作环境、落实民族地区驻村工作队与村“两委”的合作行为等优化路径,以期促进二者的合作,巩固拓宽脱贫攻坚成果,实现与乡村振兴的有效衔接。