在谱系分化过程中生态位是趋于保守或是分化一直存在较大争议。谱系分化初期生态位保守性的研究对深入了解这一过程至关重要。本研究结合生态位模型和物种遗传信息,以鬣蜥科的两个物种(蜡皮蜥Leiolepis reevesii和变色树蜥Calotes versicolor)为研究对象,评估了生态位进化对物种谱系分化的影响。本研究基于物种已有的谱系信息,构建生态位模型模拟各谱系的生态位空间,研究每个物种内谱系间的生态位差异(用Schoener’s D值和Hellinger’s I值估算)和地理分布区差异(用地理重叠指数和相互预测指数估算)。Schoener’s D值和Hellinger’s I值用两种方法来计算:生态位一致性检验和背景检验。结果显示蜡皮蜥的两个谱系之间存在部分相似的生态位空间,而变色树蜥谱系间的生态位空间存在显著差异。地理重叠指数和相互预测指数的计算结果表明,蜡皮蜥和变色树蜥A支的潜在分布区均包含了B支的潜在分布区。蜡皮蜥A支的潜在分布区覆盖面积广,包括北部湾沿岸的部分地区、雷州半岛、海南和越南等地区,B支的潜在分布区域仅局限于五指山和鹦哥岭山脉以南的沿海地区。变色树蜥A支的潜在分布区覆盖了整个研究区域的全部沿海地区,B支的潜在分布区仅分布于海南省的中部和南部。本项研究结果支持生态位空间差异导致异域物种形成的假说,即物种的遗传分化过程中伴随着生态位的分化。研究结果还表明,气候环境特化在推动蜡皮蜥和变色树蜥谱系分化和生态位分化的过程中发挥了重要作用。通过结合物种遗传信息,生态位模型使物种进化的分析得以实现。