猪链球菌荚膜多糖基因簇的分析及血清型分子检测方法的建立

来源 :中国疾病预防控制中心 | 被引量 : 5次 | 上传用户:uto
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪链球菌(Streptococcus suis)是可导致人与猪严重疾病的人兽共患病病原体。目前,根据猪链球菌荚膜多糖(capsular polysaccharide,CPS)的抗原性不同分为33个血清型。而荚膜多糖的产生及不同血清型之间的差异又由基因组中的荚膜多糖基因簇(cps cluster)所决定。之前,已经有针对15种血清型cps cluster中的血清型特异基因建立的单重或者多重PCR (mPCR)方法。在本研究的第一部分,我们建立了一套鉴定目前公认的33种血清型的mPCR方法。为了识别每个血清型的型特异基因,我们把33种血清型参考菌株做了高通量基因组测序,从中截取了每个血清型的cps cluster,并通过序列比对确定了每个血清型的型特异基因。我们选取了血清型特异基因中的wzy作为靶基因建立了4个mPCR反应体系(set1~4)。因为血清1型和14型的cps cluster,2型和1/2型的cps cluster高度同源,所以除了血清1型和14型,2型和1/2型,所有的血清型均可以由这套mPCR体系鉴定。mPCR体系的setl用来检测12种病人与病猪中最常见的血清分离型别(血清型1~10,1/2和14);set2检测10种血清型(除血清14型外的血清11~21型);set3检测剩下的11种血清型(血清22~31和33型);set4用来检测表型为21和29型抗血清交叉凝集的新型cps cluster。在第一部分的研究中,仍然有大量菌株不可用血清凝集实验和已建立的mPCR方法(set1~4)鉴定。第二部分的研究中,我们选取了32株这样的菌株进行了全基因组高通量测序,并分析了它们的cps cluster,发现了10种新cps cluster型别。新cps cluster型别我们将它们分别命名为cps Ⅰ~cps X,然后针对这10种新cps cluster型别我们又建立了另外2个mPCR体系(set5和set6),mPCR体系set5用来鉴定7种新cps cluster型别cps Ⅰ~cps Ⅶ;set6用来鉴定3种新cps cluster型别cps Ⅷ~cps Ⅹ。我们在本研究中所建立的一系列多重PCR体系为鉴定猪链球菌血清型或cps型别提供了一种经济、快速并特异的方法。
其他文献
目的探讨三维超声在产前胎盘植入诊断中的应用效果。方法以2014年3月-2018年12月经我院超声科产前筛查时疑似为胎盘植入并于我院分娩的40例病例作为研究对象,以产后病理结果
目的:了解危重患者急性胃肠损伤现状,探讨危重患者急性胃肠损伤的影响因素,并对危重患者胃肠音进行监测和分析,制定危重患者急性胃肠损伤分级评价工具,为医护人员更加客观量化
乳腺癌是全世界女性发病率最高的恶性肿瘤,影像学手段在乳腺癌的筛查、早期诊断、分期、疗效评价等方面发挥了重要的作用。纳米材料已经广泛应用于生物医学领域,其中磁性纳米
[摘要]本文以移动通信行业内部审计整改跟进为出发点,依托中国移动上海公司自身的系统开发资源,运用设计思维,将机器人流程自动化(Robot Process Automation,简称RPA)、自然语言处理(Natural Language Processing,简称NLP)和数据爬虫等技术应用于实践,对企业内控平台进行重构和优化,开发出一种数字化内部审计整改跟进系统。  [关键词]审计整改 跟进系
税收风险管理是指各级税务机关将风险管理的理念运用到税收征管模式中,运用信息化手段,对涉税数据进行风险比对,最终发现税收风险疑点并消除风险点,防止发生国家税款的流失。
目的通过对头位分娩中正常产程与异常产程的对比研究,探讨影响头位难产的因素,从而探讨头位难产的防治。方法对227例住院分娩者,分为正常产程组和异常产程组。对两组的胎儿体重
中国制造业在我国拥有坚实的基础地位和完善的工业体系,一直备受政府的关注,但在技术创新方面却鲜有突破。根据政府最新的战略发展纲要,制造业创新发展成为最为重要的议题,而
文章针对公司轧钢设备循环水系统存在运行能耗浪费的问题,结合实际生产工况,从循环水系统工艺、设备、管理三方面入手,在坚持生产安全、稳定、效益最大化的基础上优化循环水
目的:探讨对急性有机磷农药中毒合并呼吸衰竭的患者实施早期机械通气治疗的临床效果。方法:选取急性有机磷农药中毒合并呼吸衰竭的患者79例,对患者的临床资料、抢救过程和实施