目的：研究慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡二种不同疾病的同属于气虚血瘀证、气滞证、湿热证的这三个常见证型的不同代谢组学特征。从代谢组学的角度,阐明中医证型的物质基础。方法：选择门诊及住院的慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡病人(均来源于苏州市中医医院),按中医辨证分型,选择气虚血瘀型、气滞型和湿热型,收集胃镜病理标本、血液标本,进行病理描述及代谢组学分析研究。将实验结果进行多元数据分析及比较。结果：消化性溃疡、慢性萎缩性胃炎同属于气虚血瘀证、气滞证、湿热证及正常对照组在代谢物图谱上存在差异；气虚血瘀证消化性溃疡、萎缩性胃炎之间代谢物图谱上存在差异,气滞证及湿热证的消化性溃疡、慢性萎缩性胃炎之间在代谢物图谱上差异不明显。结论：气虚血瘀证、气滞证、湿热证三种证型在代谢谱上及正常对照组存在差异,这些差异代谢物可能是证型形成的物质基础之一。同种疾病的气虚血瘀证、气滞证、湿热证三证之间在代谢谱上存在差异,这可能是同病异治的物质基础之一；气滞证、湿热证的消化性溃疡及慢性萎缩性胃炎之间差异不明显,符合异病同治理论,而气虚血瘀证的消化性溃疡及慢性萎缩性胃炎之间存在差异,说明异病同治并不适用于所有情况。