RNA m~6A甲基化修饰基因在急性白血病患者骨髓单个核细胞中的mRNA水平表达及其临床意义

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[目的]本文将初步探讨RNAm6A甲基化修饰基因METTL3、METTL14、ALKBH5、FTO和WTAP在急性白血病患者骨髓单个核细胞(Bone Marrow mononuclear cells,BMMCs)中的mRNA表达水平及其临床意义。[方法]收集2015年07月至2018年12月就诊于苏州大学附属第一医院的147例初诊急性白血病患者及19例正常骨髓干细胞供体的骨髓样本,其中急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia,AML)81 例(包括 AML-M0 型 1 例,AML-M1 型 14 例,AML-M2 型 29 例,AML-M3 型 7 例,AML-M4 型 15 例(M4EO 7 例),AML-M5 型14例,不明分型1例)、急性混合细胞型白血病(hybirdactueleukemia,HAL)2例、急性 B 淋巴细胞白血病(Acute B lymphoblastic leukemia,B-ALL)40 例、急性 T 淋巴白血病(Acute T lymphoblastic leukemia,T-ALL)24 例,采用 Ficoll 梯度离心方法提取BMMCs中的总RNA,进行反转录,荧光实时定量PCR方法检测急性白血病BMMCs 中 RNAm6A 甲基化修饰基因 METTL3、METTL14、ALKBH5、FTO、WTAP的mRNA表达水平的差异,其表达量以2-ΔCT值表示。结合患者初诊时血常规、骨髓FAB分型、融合基因、染色体、二代测序基因突变结果,以及WT1、EVI定量水平,分析5种RNAm6A甲基化修饰基因的表达与以上临床特征的相关性,同时分析了 5种基因的mRNA表达对疗效、总生存、无病生存和复发的影响。[结果]1、147例患者中位随访期9月(1-47月),除外7例急性早幼粒细胞白血病,其余74例AML患者中检测到NPM1突变阳性22例,FLT3-ITD突变阳性31例,DNMT3A突变阳性19例,CEBPα双突变阳性18例,IDH1突变阳性4例,TP53突变阳性4例,ASXL1突变阳性6例,NRAS突变阳性13例,EZH2突变阳性6例,c-Kit突变阳性5例,TET2突变阳性10例,GATA2突变阳性10例,RUNX1突变阳性6例。对接受治疗的69例AML患者进行疗效评估,1疗程诱导化疗后达完全缓解(complete remission,CR)50 例,部分缓解(partial remission,PR)4 例,未缓解(non-remission,NR)15例,经过2疗程诱导化疗后达CR 14例,PR 2例,NR 3例,至随访终点,持续缓解共计49例,复发11例,死亡9例。对40例B-ALL患者进行分析,其中检测到BCR-ABL融合基因阳性18例,阴性34例,TEL-AML1阳性1例,MLL阳性4例,E2A-PBX1阳性1例。二代测序结果为RUNX1突变2例,FLT3-ITD突变4例,TP53突变3例,NRAS突变3例,NOTCH1突变1例,PHF6突变1例,BCOR突变4例,PAX5突变3例。除1例未接受治疗,对39例接受诱导化疗的患者进行疗效评估,1疗程CR的患者33例,NR 6例,而6例NR患者中2疗程诱导化疗CR4例,持续不缓解2例。至随访终点,持续缓解共计23例,复发11例,死亡5例。对24例T-ALL患者进行分析,其中SIL-TAL1融合基因3例,SET-NUP214融合基因2例,阴性19例,二代测序主要结果RUNX1突变阳性3例,PHF突变阳性4例,NOTCH1突变阳性7例。24例T-ALL患者中1例未行治疗,23例患者1疗程诱导化疗达CR 20例,NR3例,在3例NR患者中,持续不缓解者1例,死亡2例。至随访终点,持续缓解13共计例,复发4例,死亡6例。2、我们比较了急性白血病组和健康对照组5种基因的表达差异,其中WTAP、METTL3、METTL143种基因mRNA的相对表达量在急性白血病组明显高于健康对照组(p<0.001)。而FTO基因的mRNA的相对表达量低于健康对照组(p<0.05)。在两组之间ALKBH5基因的表达差异无明显统计学意义。我们进一步比较了这些基因在不同类型白血病中的差异,AML组和ALL组比较,后者的METTL3和WTAP基因表达量明显增高(p<0.0001),而METTL14基因的mRNA表达量在AML组中高于ALL组,但差异无统计学意义(p>0.05)。在AML组各个亚型中,METTL3基因高表达于M1型(p<0.05)。在急性淋巴细胞白血病组中,T-ALL组的FTO基因、WTAP基因的mRNA表达水平显著高于B-ALL组(均p<0.05)。3、我们分析了 METTL3、METTL14、ALKBH5、FTO、WTAP 基因的 mRNA 表达情况与临床特征的相关性。在除外M3的74例AML患者中,5种基因与患者的性别、年龄、初诊时白细胞计数、血小板计数、染色体核型等因素无明显相关(p>0.05)。WTAPmRNA表达水平与WT1表达量呈正相关(r=0.681,P<0.0001)。此外,在NPM1+组的患者中METTL3基因mRNA表达较阴性组升高(p<0.05),WTAP mRNA表达水平在FLT3-ITD+组中较阴性组显著升高(p<0.05),在CEBPα双突变组与无突变组比较WTAPmRNA表达水平则显著降低(p<0.05)。在B-ALL组中,高白细胞计数组患者METTL3基因的mRNA表达水平显著高于低白细胞计数组(p<0.05);WTAP基因mRNA表达水平在BCR-ABL融合基因阳性患者中明显下降,但其表达水平在WT1阳性组患者中显著增高,差异有统计学意义(均p<0.05),其他基因的表达与患者的临床特征及预后因素均无明显相关性(p>0.05)。T-ALL组中,5种m6A甲基化修饰基因的mRNA表达水平经统计与患者临床及生物学预后因素均无明显相关性(p>0.05)。4、所有接受规范诱导化疗的急性白血病患者,METTL3、METTL14、ALKBH5、FTO、WTAP基因mRNA表达水平与缓解率无明显相关,METTL3、METTL14、ALKBH5、FTO基因mRNA表达与患者累积复发率、总生存时间和无病生存时间均无明显相关。仅在B-ALL中,WTAP基因的高表达组无病生存率明显下降(p<0.05),累积复发率显著升高(p<0.05)。[结论]1.m6A甲基化修饰基因METTL3、METTL14、FTO、WTAP在急性白血病骨髓单个核细胞中的表达存在显著差异;2.在不同类型急性白血病中,骨髓单个核细胞中的METTL3、METTL14、FTO、WTAP基因表达也存在差异,并且和临床特征存在一定的相关性;3.B-ALL患者预后可能与RNA m6A甲基化修饰密切相关
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