对公民基本权利的司法保护已成为当代宪法与宪政的一个重要的发展趋势。本文对于如何完善公民基本权利的司法保护进行了深入的探讨。在第一章，阐明了公民基本权利的涵义，重点论述了公民基本权利与相近概念的法律联系与区别，从而明确了公民基本权利的司法保护的对象。然后，又从不同角度阐述了对公民基本权利进行司法保护的重要意义。第二章，采用对比的手法，分析中外公民基本权利的司法保障制度的异同，取人之长，弃人之短，为完善我国公民基本权利司法保护提供参考与借鉴。第三章，对我国公民基本权利司法保护的现状、存在的问题及其产生的原因进行了系统地阐述。 结合以上分析，在第四章提出完善我国公民基本权利司法保护的对策思考：树立正确的宪法观念；赋予公民基本权利直接效力；完善立法。最后，在借鉴外国成功经验，紧密结合我国实际情况并对当前学者提出的多种基本权利司法保障制度的模式进行比较研究的基础上，提出建立双轨模式的公民基本权利司法保障制度的主张。所谓“双轨模式”，即最高人民法院设立宪法法庭受理有关公民基本权利受到侵害的案件；对于法律、地方性法规、行政法规及行政规章违反宪法侵犯公民基本权利的案件，由全国人大设立的宪法委员会进行审查。