并购是企业通过收购其他企业壮大自身实力的一种方式，并购这种方式越来越频繁的发生，但是很多并购案例都是以失败而告终，究其根源，没有科学合理地开展整合工作是其中一重要原因。基于内部控制的重要性，在并购整合的众多内容之中双方企业的内部控制整合是处于首要地位的。良好的并购后内部控制整合可以为企业创造价值，促使并购结果的成功，因此，关于内部控制整合也日益成为并购企业研究的热点问题。本文结合并购后整合的内容以及内部控制相关知识，从战略管理整合、组织结构整合、控制活动整合、人力资源政策与实务整合以及企业文化与沟通整合这五个方面进行并购企业内部控制整合以及开展对整合工作的评价。首先，将并购企业内部控制整合过程划分为前期评估及规划、后期整合实施两个阶段。在整合前评估及规划阶段，并购企业需要分别从战略、组织结构、控制活动、人力资源、企业文化方面对参与并购的双方企业进行尽职性调查与评估，制定出评估报告，为后期整合工作的开展做好铺垫。在整合实施阶段，按照先期制定出的各部分整合评估报告实施内部控制制度整合。其次，本文建立了并购后内部控制整合评价指标体系，将并购后内部控制整合效果评价分为定性评价和定量评价两个方面。定性评价主要是对并购企业内部控制整合内容和过程进行评价，利用层次分析法和专家打分法的思想对内部控制整合进程进行评分，研究其过程是否完善与合理；定量评价是通过主成分分析计算内部控制整合带来的协同效应进行的；在定性和定量评价的基础上，利用简单评价方法得出并购企业内部控制整合的整体绩效。最后，以潍柴动力并购湘火炬作为案例，对其并购后内部控制整合的过程和结果进行研究与分析。