传统的抗原抗体反应来检测肠致病性大肠杆菌(EPEC)是一种很重要的微生物检测方法，可用于流行病学调查。但是，用抗血清分型的过程过于复杂，因此仅限于少数参考实验室使用。　　 为了改善这种状况，我们发明了一种基于生物芯片技术的基因水平上的检测方法。用于检测O-抗原血清型的靶基因为编码O-抗原聚合酶的基因(wzy)，用于检测H-抗原血清型的靶基因为编码鞭毛蛋白亚单位的基因(filC)。　　 从生物信息学分析和探针设计做起，我们研发了一种用于检测肠致病性大肠杆菌血清型的基因芯片：首先用一种快速、有效的方法提取DNA，再用多重PCR方法扩增靶基因，扩增同时进行Cy3标记，最后分析杂交结果。该芯片包含用于检测16种不同的O-抗原血清型(O18，O20，O26，O44，O55，O86，O111，O112ac，O114，O119，O125，O126，O127，O128，O142，O158)的探针和15种不同的H-抗原血清型(H2，H6，H7，H8，H9，H11，H16，H18，H19，H21，H25，H28，H34，H40，H49)的探针。　　 用检测范围内血清型的菌种和近缘菌株对该芯片进行性能评价，结果证实它有很高的灵敏性和特异性，16种O血清型和15种H血清型均能被准确检测出。该基因芯片检测技术被证实为传统血清分型的良好替代方法，并可以在一天内得到样品检测结果。