莲草直胸跳甲细胞色素P450的生物信息学分析

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大多数昆虫产生抗药性和对寄主植物的适应性主要归功于P450酶系对杀虫剂及其他外源物质的代谢作用。从生物信息学的角度分析鉴定莲草直胸跳甲(Agasicles hygrophila)细胞色素P450酶系中CYP4、CYP6、CYP9等亚家族基因的蛋白质结构和特征,并推测其可能的功能。采用生物信息学的方法对莲草直胸跳甲细胞色素P450蛋白的理化性质、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、二级结构、高级结构、多序列比对及系统发育树进行了预测和分析。实验室前期工作中已经克隆鉴定出莲草直胸跳甲(A.hygrophila)包括CYP3、CYP4、CYP6、CYP9等家族在内,共9条P450基因,分别命名为CYP347J1、CYP4FE1、CYP4G116、CYP4G117、CYP6HR1、CYP6HS1、CYP9Z53、CYP9Z54、CYP9Z55,cDNA全长在1614bp~1788 bp,编码498~586个氨基酸。莲草直胸跳甲细胞色素P450不含有信号肽,亚细胞定位绝大部分为细胞质,一般含有跨膜结构。莲草直胸跳甲细胞色素P450的二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,高级结构由相邻两个半胱氨酸残基之间的二硫键形成的α螺旋,保持一个疏水的空腔和亲水表面。多序列比对显示莲草直胸跳甲细胞色素P450基本符合昆虫P450的保守结构域。系统发育显示莲草直胸跳甲P450在种内和种间均具有较高的相似性。莲草直胸跳甲细胞色素P450蛋白具有丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸蛋白激酶的磷酸化位点;含有丝氨酸、苏氨酸蛋白激酶的糖基化位点;含有丙氨酸蛋白激酶的乙酰化位点。本文预测九个莲草直胸跳甲P450基因的蛋白质可能具有的结构及功能,通过鉴定与分析为进一步研究莲草直胸跳甲生物功能奠定了理论基础。
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