中国共产党十六届五中全会提出了我国将全面推进社会主义新农村建设的历史任务，这是我们党统揽全局、放眼未来、与时俱进，作出的重大历史性决策，这一战略举措将惠及到我国亿万农民、关系到国家的长治久安，是我国全面推进社会主义现代化建设重要历史时期所必须要承担和完成的重要使命。土地承包经营权入股流转作为解决我国“三农”问题的一个突破点，本研究分析了当前土地承包经营权入股流转的必要性，在对农村土地承包经营权入股理论研究和实践探索的基础上，结合当今学术界研究不足，从理论上对土地承包经营权入股流转的可行性进行了全面的剖析，使得土地承包经营权入股流转具有合理和可行的理论基础;同时，对我国现有的土地承包经营权入股三种实践模式：农村土地承包经营权入股股份合作制企业；农村土地承包经营权入股股份制公司；农村土地承包经营权入股农民合作社。进行了详细的分析评述，得出农村土地承包经营权入股农民专业合作社为当下切实可行的模式。并对农村土地承包经营权入股农民合作社的现实障碍和法律困境进行了剖析，提出对策及建议。按照研究思路，各部分安排如下:第一部分为绪论。介绍了农村土地承包经营权入股流转选题的背景，农村土地承包经营权入股流转的重要意义。第二部分为土地承包经营权入股流转理论分析。界定了土地承包经营股权入股的相关概念。对农村土地承包经营权入股流转进行了法理分析。剖析了农村土地承包经营权入股的本质。通过对基础理论的分析研究，奠定了我国农村土地承包经营权入股流转体系的理论基础。第三部分为我国关于土地流转的法律及其政策指引。罗列了当下的法律规定：宪法及宪法性文件、法律、地方性法规、规章；以及中国共产党第十六届中央委员会第三次全体会议通过的《关于全面推进社会主义新农村改革发展若干重大问题的决定》。第四部分为三种实践模式剖析。对土地承包经营权入股流转的三种实践模式进行了详细的分析评述，得出农村土地承包经营权入股农民合作社为当下切实可行的模式。第五部分为法律障碍及现实困境。对农村土地承包经营权入股农民合作社当前实践进行了详细的剖析，指出其流转过程中存在的一系列法律障碍和现实困境。第六部分为对策建议。对第五部分农村土地承包经营权入股理论实践剖析的基础上指出其流转过程中存在的一系列的法律障碍和现实困境，提出了对策和建议。