【摘 要】
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强的人工和自然进化选择已经导致了基因组区域高度保守单体型区域的形成,这些单体型区域携带与目标性状相关的候选基因。全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）与单体型分析相结合已成为一种分析作物复杂性状遗传结构的有效方法。24 338个高质量SNP被用于油菜硫苷和株高全基因组关联分析。分别检测到20和38个SNP与硫苷含量和株高显著关联的SNP位点。（1）
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强的人工和自然进化选择已经导致了基因组区域高度保守单体型区域的形成,这些单体型区域携带与目标性状相关的候选基因。全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）与单体型分析相结合已成为一种分析作物复杂性状遗传结构的有效方法。24 338个高质量SNP被用于油菜硫苷和株高全基因组关联分析。分别检测到20和38个SNP与硫苷含量和株高显著关联的SNP位点。（1）在C03染色体上,检测到单体型区域（57,830,409-58,283,210 bp;r~2=0.96）与硫苷含量显著关联。在这个单体型区域,携带与硫苷含量相关的拟南芥同源基因Bn BCAT4-C03。我们利用50个重测序材料对这个单体型区域进行了进一步的区域关联分析,揭示了Bn BCAT4-C03基因区域单体型结构变异影响了硫苷的积累。结合基因共表达网络分析,表明Bn BCAT4-C03与硫苷合成路径中的基因形成了分子网络调节硫苷的合成与积累。（2）在A03染色体上,检测到一个Bn GPI2-A03基因与株高显著相关。根据该基因的单体型等位基因对应的材料表型,分别选择了7个极端高（A组）和极端矮的材料（B组）,对这两组材料的茎秆顶端分生组织进行RNA-Seq和激素含量测定分析,我们发现A组材料的Bn GPI2-A03基因表达以及反式玉米素核糖苷（t ZR）和异戊烯基腺苷（i PR）含量要显著高于B组材料。我们推测该基因受细胞分裂素信号调控,影响了油菜株高。通过对硫苷和株高的显著关联区域的单体型结构分析,有利于我们开发单体型功能标记,进一步降低油菜种子中硫苷含量以及选育适度矮秆材料。
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