保税港区作为物流体系中重要的支点，具有发展第三方物流得天独厚的优势和条件。因此研究基于保税港区的第三方物流运作模式具有重要的理论和实用价值。本文重点探讨了基于重庆保税港区的第三方物流运作模式。文章在阐述保税物流和第三方物流的相关理论及当前重庆保税港区第三方物流发展状况的基础上，对重庆保税港区发展第三方物流进行了SWOT战略分析，着重运用归纳、对比等方法对其腹地产业特征、客户构成、需求特点、货物类别等方面进行了比较，明确了重庆保税港区发展第三方物流的战略选择，接着结合重庆保税港区自身特点和现有条件，进一步梳理出重庆保税港区港发展第三方物流的发展原则，在此基础上探讨了保税港区发展两种第三方物流模式的可行性——保税港区仓储配送模式和保税港区综合物流服务模式，逐个阐述其功能作用、运作流程、运作功能、运作要素和应用收益以求说明这两种模式在理论上的典型性和实践上的可操作性，并在最后又从基础设施建设、人才引进、信息中心平台建设、开展多项增值服务、国际化标准等方面阐述重庆保税港区发展第三方物流的实现途径。