学科结构是大学学科的存在形式和基本框架,是大学一切结构的基础和依据,直接关系到大学整体功能的发挥和全局的发展。随着高等教育改革的深入发展,高等农业院校的学科布局发生了结构性的调整,已从单一的农业学科向以农学为主的多门类、多学科的综合性大学迈进,学科结构优化问题逐渐成为战略管理问题,贯穿于高等农业院校的发展战略规划与实践活动中。合理的学科结构不仅能促进高等农业院校综合实力的不断提升,也能带动农业经济、科技、社会等各方面因素的持续发展。因此,研究高等农业院校的学科结构优化问题,不仅是实现高等农业院校自身发展战略的客观需求；也是提高高等农业院校社会适应性的必然选择。本文首先指出学科结构优化的方向、标准和依据。即高等农业院校的学科结构优化必须遵循适应性原则、系统性原则、针对性原则、引导性原则等。评判其学科结构是否合理的标准包括看其是否符合农业产业结构调整的趋势,是否适应农业科技发展的内在需求,是否满足新农村建设的需要以及是否体现农业院校自身的发展定位。我国高等农业院校经过百年发展,在学科结构优化方面取得了一定的成绩。学科门类齐全,农学优势显著,农学向非农渗透趋势增强。但同时也存在一些不容忽视的问题,笔者通过收集我国主要高等农业院校学科结构的数据对其现状及其存在的问题加以说明,从而为提出优化我国高等农业院校学科结构的对策建议奠定基础。笔者还通过总结国外高等农业院校学科结构的发展趋势进行比较分析,从而为我国高等农业院校学科结构的调整与优化提出一些有益的启示。综合上述分析,笔者总结我国高等农业院校学科结构优化应达到的目标,并从农业学科、非农学科及其相互关系三个方面提出如何优化的思路,在此基础上,从学科规划、学科制度、学科组织管理以及学科文化整合四个方面提出保障性措施,从而保证高等农业院校学科结构调整与优化的顺利实施。