具备可持续发展特征的生态农业和生态旅游业是对当前我国传统农业和旅游业的升级转变。生态农业主要是通过农业机械化、土地规模化、技术创新和技术集约化的途径来提升农业生产力水平、农产品的原生态水平和农民的收入水平。而生态旅游业提倡摈弃传统旅游业无序无节制地消耗资源，提倡在旅游承载力约束下进行旅游开发，从而提升旅游产品的高品味性、环保性和经济效益。目前，大多数研究都是将这两个产业分开独立研究。虽然到目前为止，生态旅游和生态农业在单独领域已经取得了丰硕的成果，但仍然缺乏对两个产业的协同演化机制研究，缺乏连续性的、系统的动态分析。尤其是生态农业和生态旅游业的耦合机制研究领域还基本属于空白。　　 论文的研究对正处在经济转型时期的三峡库区，是十分必要的。三峡库区具备实现跨越式发展的巨大的资源，但随着三峡工程完工，也出现了一系列有待解决的新农村建设问题。首先，库区具有发展生态农业得天独厚的优势。远离工业密集区，土壤、空气等很少被污染，生物多样化，种群间制衡机制完备。其次，库区也具备发展生态旅游业的区位优势，库区位于长江三峡旅游黄金线路的黄金路段上，本身就具备旅游产业的基础和品牌影响力。所以完全可以将自然资源优势和生态环境优势通过生态农业和生态旅游业的强力拉动有效地转化为商品优势和经济优势。而且，三峡工程的竣工和移民的迁建造成的生态系统脆弱化和产业结构的空心化，加之库区传统农业耕种背景下的低收入状况，也要求在没有密集工业的现实情况下必须发展生态农业和生态旅游业耦合的新型产业系统。因此，研究生态农业和生态旅游业两大产业的耦合机制，所取得的研究成果不仅为三峡库区产业结构调整、经济增长方式转型和库区社会主义新农村建设提供建议，而且也为其他区域的产业结构调整提供参考。　　 论文在介绍研究背景与意义、思路与内容、特色与创新以及相关理论研究综述的基础上，对生态农业和生态旅游业耦合机制进行了研究，得到了创新性结论如下：　　 ①运用大系统理论对产业耦合的过程进行机理分析，建立单一的封闭产业系统的发展模型和耦合的开放产业系统的发展模型。进行耦合过程中不同互动关系下产业发展的效应分析，模型推导结论显示，产业间的不同关系对开放产业系统的耦合有着非常重要的影响。在开放产业系统中，互补产业可以直接导致产业耦合。相互竞争的产业在某些特定的强约束下可能促进产业耦合。其中，产业的替代效应与潜在市场规模、资源容量和污染排放及控制阀值对产业的耦合起关键作用。　　 ②模型刻画了封闭和开放产业耦合系统中资源的最优利用问题，对不可再生资源和可再生资源的最优配置进行分类描述。区别了资源在耦合产业系统中的竞争性消耗和合作性消耗两种开发方式，模型推导显示，相互合作比相互竞争对于资源的开发和消耗更具有可持续性。合作性产业耦合通过对基于资源生产出的产品的价格控制来延长资源的开采和使用时间，在一定程度上延缓了资源的消耗。最后构建出基于资源消耗、劳动力供给、环境压力和容量约束下的生态农业、生态旅游业耦合产业系统的最优配置模型。　　 ③引入产业系统结构负熵概念，通过数理模型刻画、分析生态农业、生态旅游业的耦合产业结构负熵，选取典型地区进行实证分析，验证从封闭的传统农业、传统旅游业生产模式向开放的生态农业、生态旅游业耦合产业的升级转型中，产业发展潜力增强，产业发展规模扩大，产业结构负熵降低，产业系统趋于有序化发展。　　 ④讨论两大产业系统间、政府与产业系统间的耦合博弈行为。主要包括对两个主要机制的研究。在对耦合系统产权管理决策机制的研究发现：中央政府对两大产业耦合系统的产权管理进行严格的统一管理所带来的预期收益实际将大于将两大产业耦合系统产权管理放在地方政府进行管理，中央政府仅在宏观政策上对其进行管理所带来的经济收益。并且由于该结论仅从经济角度进行判断，尚未将环境损失、社会福利损失纳入，这预示政府的实际损失实际更大。因此作为一个理性政府，可以认为政府在对生态农业和生态旅游业耦合系统产权管理模式改革中，将趋向于加强对耦合系统产权的统一管理。　　 在对生态农业和生态旅游业利益分配机制研究发现，耦合产业系统内的两部门存在合作竞争关系，并且耦合系统内部存在准超额利润，耦合系统中有比较优势的主管部门需要采取激励和惩罚措施来降低比较劣势主管部门的违约诱惑。在重复性耦合过程中给予比较劣势主管部门比一次性耦合过程中更高的收益分配比例，会降低其违约诱惑。同时，应控制比较劣势主管部门在长期耦合过程中所得收益比例的增长幅度，以免增强相对优势主管部门的背约倾向。