2型糖尿病与PTPN1、GLUD1基因启动子区甲基化的相关性研究

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目的:  2型糖尿病(Type2 diabetes mellitus,T2DM)是由遗传与环境因素等多重因素共同作用而引起慢性葡萄糖代谢紊乱性疾病。表观遗传学是由 Waddington首次提出并用来阐述基因与环境之间的相互作用对疾病产生的影响。其中,DNA甲基化是T2DM发生发展中非常重要的表观遗传调控机制。本研究主要通过对 PTPN1及GLUD1基因的DNA甲基化研究,来探讨其 DNA甲基化与 T2DM患病的相关性,从而为预测 T2DM的发生发展提供可能的生物学标记。  材料和方法:  收集深圳南山慢性疾病控制中心非肥胖的T2DM患者及性别、年龄相匹配的正常对照组的外周血样本各97例。通过 Lab-Aid核酸自动提取仪从外周血液中提取全基因组 DNA,将其亚硫酸盐修饰后进行 PCR特异性扩增。采用焦磷酸测序技术检测 PTPN1、GLUD1候选基因启动子区域的DNA甲基化修饰水平。运用SPSS18.0统计软件进行数据处理,分析 DNA甲基化与 T2DM患病及临床特征的相关性。  结果:  通过焦磷酸测序技术检测发现PTPN1基因启动子区域CpG1-8的甲基化水平均高于正常对照组,有显著的统计学意义(15.98±9.18 vs12.00±9.03,P=0.001;8.68±4.48 vs6.41±3.16,P=0.002;6.98±3.11 vs5.57±1.88,P=0.001;18.87±8.09 vs15.46±5.76,P=0.003;7.51±3.69 vs6.23±1.75,P=0.007;5.21±1.24 vs4.60±0.87,P=0.001;5.15±1.60 vs4.84±1.39,P=0.036;4.89±0.76 vs4.37±0.70,P=0.001);按性别分层后进行分析发现,在女性中 T2DM的PTPN1基因启动子区域的平均甲基化水平与 T2DM的患病具有显著相关(P=4.82E-04);此外,在女性中 PTPN1平均甲基化程度与低密度脂蛋白、总胆固醇呈负相关性  (r=-0.183,P=0.046;r=-0.310,P=0.001);而在男性中 PTPN1平均甲基化程度与年龄呈正相关性(r=0.276,P=0.017)。GLUD1基因启动子区域 CpG1-5的甲基化水平均低于正常对照组,有显著的统计学意义(3.87±3.64 vs4.36±1.96,P=0.003;9.77±6.44 vs13.16±7.16,P=2.93E-04;3.48±3.32 vs3.52±1.22,P=0.022;18.57±5.62 vs14.56±6.55,P=3.31E-05;3.75±3.24 vs5.11±2.21,P=4.01E-05);按性别分层后进行分析发现,在女性中 T2DM的GLUD1基因启动子区域的平均甲基化水平与 T2DM的患病具有显著相关(P=0.001);此外,尽管在男性中 T2DM的GLUD1平均甲基化水平与对照组无显著差异,但GLUD1平均甲基化程度与肌酐值呈负相关性(r=-0.290,P=0.013)。  结论:  PTPN1基因启动子区域CGI中所检测的CpG1-8位点的高甲基化水平与中国女性 T2DM的患病具有相关性;GLUD1基因启动子区域 CGI中所检测的CpG1-5位点的低甲基化程度也可增高中国女性 T2DM的患病具有相关性;这些发现可能为早期预防并延缓 T2DM发生提供新的线索。
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