中缅边境腾冲、那邦两地常见血红蛋白病基因突变谱及与疟原虫种群关系的研究

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chengmoshijing
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]中缅边境位于云南省和缅甸接壤地区,经济欠发达,是历史和现今的疟疾高发地区,早期的流行病学调查显示该地区有很高的血红蛋白病携带率。边境线一带少数民族以傣族、德昂族、景颇族等为主,其中景颇族是云南省特有的少数民族。早先的研究显示景颇族中血红蛋白病包括异常血红蛋白病和地中海贫血具有较高的携带率,并认为与疟疾的选择作用有关。其中常见的异常血红蛋白E(HbE)并发β地贫将会导致严重的贫血。本研究通过调查中缅边境疟疾流行区云南省德宏州盈江县那邦镇景颇族和腾冲市汉族常见血红蛋白病的携带率,并进行上述两地疟疾并发血红蛋白病患者的疟原虫基因分型、疟原虫密度检测,研究上述地区血红蛋白病的基因突变谱,同时探讨上述地区血红蛋白病与疟原虫种群之间的关系。[方法]第一部分非疟疾样本血红蛋白病基因突变谱分析:1.1,样本采集。收集2013-2017年中缅边境云南省腾冲市汉族1016例样本(男648例,女368例),年龄10-88岁;收集德宏州盈江县那邦镇景颇族样本,816例(男362例,女454例),年龄16-84岁。样本收集通过昆明医科大学伦理委员会批准,采集对象同意并签署知情同意书所有调查对象之间无血缘关系,无孕妇和哺乳期妇女。巢式PCR定向扩增疟原虫18SrRNA基因排除疟疾感染。1.2,血红蛋白病的初筛。对全血样本,以血常规参数及红细胞脆性实验作为血红蛋白病初筛依据,设定血常规参考值为MCV<80fl,MCH<27pg。溶血率>65%时为正常,溶血率<65%为判断地贫截断值,56%-64%为溶血率轻度降低,溶血率<55%为溶血率降低,当血常规数据异常或溶血率<65%时对样本进行基因诊断。滤纸血样本则直接进行基因诊断。1.3,提取所有样本全基因组DNA,使用Gap-PCR方法对所有初筛怀疑为血红蛋白病的样本进行东南亚常见缺失型α地中海贫血(-α3.7/αα、-α4.2/αα、-sea/αα,-α3.7/-α3.7)基因验证,使用巢式PCR对所有样本进行6种常见的β珠蛋白基因突变(-28,CD17、CD41/42、CD71/72、HbE、C.9T>C)扩增及直接测序分析。1.4,根据结果进行上述两地区非疟疾样本血红蛋白病基因突变谱分析。第二部分腾冲、那邦两地疟疾样本血红蛋白病与疟原虫种群关系的分析:2.1,疟疾样本的收集及疟原虫种群鉴定,2013-2017年在腾冲汉族中收集到疟疾样本226例(男212例,女14例),年龄16-60岁,腾冲疟疾样本均为间日疟(Plasmodium vivax,PV);在那邦景颇族收集到疟疾样本553例,年龄2-43岁,其中间日疟样本454例(男345例,女109例),恶性疟原虫(Plasmodium falciparum,PF)样本99例(男83例,女16例)。收集外周血0.5ml,同时制作厚薄两种血涂片,吉姆萨(Giemsa)染色,在普通光学显微镜油镜下观察薄血涂片鉴别间日疟原虫(简称间日疟)和恶性疟原虫(简称恶性疟)。在厚涂片上计数500个白细胞,最终密度按6000/μL血液的白细胞计数。疟原虫感染进一步通过巢式PCR定向扩增18SrRNA基因进行验证。2.2,疟原虫基因分型,使用 Roche High Pure PCR Template Preparation Kit 提取疟原虫基因组DNA,用QIAGEN QIAamp DNAMicro Kit提取滤纸血DNA。运用巢式PCR对间日疟原虫PvMsp-3α基因、恶性疟原虫PfMsp1和PfMsp2基因进行扩增。PvMsp-3α基因根据扩增出的条带大小可初步分为A型、B型和C型。PfMsp1基因初步分为K1、MAD20、RO33;PfMsp2基因初步分为FC27、IC/3D7。2.3,疟疾样本血红蛋白病基因检测同第一部分。2.4,疟疾样本血红蛋白病与感染疟原虫种群之间的关系用卡方(χ2)检验进行比较;疟疾样本中血红蛋白病与疟原虫密度之间的关系用Mann-Whitney U检验进行检验。[结果]1、中缅边境腾冲市汉族和盈江县那邦镇景颇族常见血红蛋白病基因突变谱:腾冲市汉族人群非疟疾样本1016例,检测出缺失型α地贫54例(5.31%,54/1016),其中-α3.7/αα 49 例(4.82%,49/1016),-sea/αα 5 例(0.49%,5/1016)。β珠蛋白基因突变中仅检测出HbE杂合突变(β26 GAG>AAG)35例(3.44%,35/1016);德宏州盈江县那邦镇景颇族非疟疾样本816例,对其中320例(女196人,男124人)进行α地中海贫血检测检,发现缺失型α地贫携带者25例(7.82%,25/320),基因型包括:-α3.7/αα 18 例(5.63%1,8/320)、-α3.7/-α3.7 6 例(1.88%,6/320)和-sea/αα 1例(0.31%,1/320);对其中719例样本进行β珠蛋白基因检测,仅发现 HbE 突变 113 例(15.72%,113/719),其中 βE/βE 18 例(2.51%,18/719),βE/βA 95例(13.21%,95/719)。那邦景颇族HbE突变率明显高于腾冲汉族(P<0.05),那邦景颇族α地贫突变率与腾冲汉族相比没有统计学意义(P>0.05)。2、中缅边境腾冲市汉族和盈江县那邦镇景颇族血红蛋白病与疟原虫种群的关系:(1)腾冲市汉族和盈江县那邦镇景颇族感染疟原虫基因分型226例腾冲市汉族PV样本进行间日疟PvMsp-3α扩增和分型,扩增成功198 例(92.96%,198/213),其中 A 型 115 例(58.08%,115/198),B 型 14 例(7.07%,14/198),C 型 50 例(25.25%,50/198),混合感染 19 例(9.59%,19/198)。454例景颇族PV样本PvMsp-3α基因分型扩增成功404例,其中A型64例(15.84%,64/404),B 型 104 例(25.74%,104/404),C 型 188 例(46.53%,188/404),混合感染48例(11.89%,48/404)。99例恶性疟扩增成功61例样本,对61例景颇族PF样本进行PfMsp1和PfMsp2基因分型,PfMsp1中发现K1(K)16 例(26.23%,16/61),MAD20(M)20 例(32.78%,20/61),RO33(R)4 例(6.56%,4/61),混合感染 21 例(34.43%,21/61)。PfMsp2 中发现 FC27(F)32 例(52.46%,32/61),IC/3D7(Ⅰ)20 例(32.79%,20/61),FC27 合并 IC/3D7(Ⅰ)9 例(14.75%,9/61),PfMsp1 合并 PfMsp2 55 例(90.16,55/61)。(2)腾冲市汉族和那邦镇景颇族间日疟疾患者血红蛋白病基因检测226例样本成功扩增出213例样本,213例腾冲汉族PV样本中检测出缺失型 α地贫 14 例(6.57%,14/213)-α3.7/αα 突变;HbE 25 例,其中 βE/βE2 例(0.94%,2/213),βE/βA 23 例(10.80%,23/213),α 地贫合并 HbE 4 例(1.88%,4/213),其中-α3.7/αα 合并 βE/βE 1 例(0.47%,1/213),-α3.7/αα 合并 βE/βA 3 例(1.41%,3/213)。C.9T>C 多态 182 例,其中纯合突变 122 例(57.28%,122/213),杂合突变 60 例(28.17%,60/213);-28 杂合突变 9 例(4.23%,9/213)。454 例样本成功扩增出405例,405例景颇族PV样本中检测出常见缺失型α地贫-α3.7/αα 24 例(5.92%,24/405);β 珠蛋白基因突变检测出βE/βA 64 例(15.80%,64/405),α 地贫合并βE/βA3例(0.74%,3/405)。(3)景颇族恶性疟患者血红蛋白基因检测99例样本成功扩增出61例,61例景颇族PF样本仅检测出HbE 5例(8.20%,5/61),其中 βE/βE1 例(1.64%,1/61),βE/βA 4 例(6.56%,4/61)。(4)腾冲、那邦两地常见血红蛋白病与间日疟原虫种群的关系213例腾冲汉族间日疟患者分出疟原虫种群A型、B型、C型疟疾共179例,其中血红蛋白病合并A型、B型、C型疟疾分别是21例(11.73%,21/179)、3例(1.67%,3/179)、11例(6.14%,11/179):405例那邦景颇族间日疟患者分出疟原虫种群A型、B型、C型疟疾共356例,其中血红蛋白病合并A型、B型、C 型疟疾分别是 19 例(5.34%,19/356)、22 例(6.18%,22/356)、40 例(11.24%,40/356)。经统计学分析,发现两地区PV样本中,血红蛋白病患者人群感染的疟原虫种群经PvMsp-3α基因分型以感染当地的优势种群为主,经统计学分析发现无偏好性(P>0.05)。我们进行了血红蛋白病中疟原虫密度分析以判断血红蛋白病对疟原虫的感染程度,发现两地区血红蛋白病患者和非血红蛋白病患者中疟原虫密度无明显差异(P>0.05)。(5)那邦常见血红蛋白病与恶性疟原虫种群的关系由于检测样本较少,达不到统计学分组要求,无法比较两者的关系。[结论]1、中缅边境腾冲市汉族人群和德宏州盈江县那邦镇景颇族非疟疾人群血红蛋白病基因突变谱以-α3.7/αα和HbE为主要的基因突变型,那邦镇景颇族HbE携带率显著高于腾冲汉族。2、中缅边境腾冲市汉族人群间日疟感染以A型为主,德宏州盈江县那邦镇景颇族人群间日疟感染以C型为主。对两地疟疾并发血红蛋白病的研究发现,血红蛋白病人群对感染间日疟原虫的种群经PvMsp-3α分型以感染当地的优势种群为主,统计学分析表明无偏好性,同时血红蛋白病不能降低疟原虫感染的严重程度。尚需扩大样本进行进一步研究。
其他文献
[目的]调查研究云南昆明石林地区彝族人群血压情况及高血压的检出率,探讨该地区高血压患病的影响因素,为该地区血压的管理以及高血压的预防和控制提供依据。[方法]采用实地测量和问卷调查的方法,共纳入云南昆明石林地区彝族人群370例为研究对象,收集患者身高、体重、上臂中围、三头肌皮褶厚度、小腿围、腰围臀围等体格检查数据和血常规、肝肾功、血脂、甲状腺功能、空腹胰岛素水平(fasting insulin FI
[目 的]本研究通过对房间隔缺损相关肺动脉高压的病人基因检测,判断房间隔缺损相关肺动脉高压的病人是否含有既往已明确的PAH致病基因突变,以便于临床得知房缺相关肺动脉高压发生与遗传基因是否相关联,更有利于早期识别干预,并能改善患者预后。[方 法]选取2018年1月至2020年12月昆明医科大大学附属延安医院诊断并收治入院的45例ASD-PAH患者的外周静脉血液标本,其中男性10人,女性35人,年龄在
[目的]采用经考评的高血压患者报告的临床结局(Patient Reported Outcomes,PRO)量表对高血压患者进行PRO评估;制定高血压PRO的最小临床重要差值(Minimal Clinically Important Difference,MCID),用于判断 PRO 得分变化的临床意义;分析不同用药方案和血压水平的高血压患者之间PRO得分差异,从心理、生理、社会等角度提出适合高血压
[目 的]通过对血管迷走性晕厥患者直立倾斜试验不同阶段的心率变异及心率减速力的定量测定及比较,进一步分析自主神经功能变化异常在血管迷走性晕厥发生过程中的作用。[方 法]收集2017年10月—2020年12月在昆明医科大学第一附属医院门诊和住院治疗就诊的高度疑似血管迷走性晕厥(Vasovagal syncope,VVS)的患者行直立倾斜试验(Head-up tilt tsting,HUTT)表现为药
[目的]探究中国云南地区汉族人群癌胚抗原相关黏附分子1(CEACAM1)基因单核苷酸多态性(rs555643516、rs927180583、rs971040608)与扩张型心肌病(DCM)的相关性。[方 法]筛选入组病例为2018年至2020年于昆明医科大学第一附属医院心脏内科确诊为扩张型心肌病患者59例为实验组及健康体检人群14例为对照组,记录入组受试者一般病史、年龄、性别、体重、身高、血压、美
[目的]1.探讨 PYCR1(pyrroline-5-carboxylate reductase 1,PYCR1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)易感性的相关性;2.探讨PYCR1基因SNPs与DCM患者BNP、NYHA分级和心脏彩超参数的相关性。[方法]1.本次研究
[目的]季节性流感和潜在的流感大流行对公众和社会构成显著的威胁,也是全球卫生系统的负担。普遍流感免疫的最终目标是通过主动免疫获得广泛而持久的保护。由于流感病毒抗原的高度变异性,每年需要根据当年预测的突变株生产相应的流感疫苗,对于实现有效的疫苗诱导的免疫提出了巨大的挑战,因此需要开发能够交叉保护多型流感病毒的通用型流感疫苗。基于流感病毒基质蛋白2的胞外区M2e的高度保守性及抗原性和表面糖蛋白血凝素的
[目 的]回顾分析近五年昆明医科大学第一附属医院深部真菌感染及光滑念珠菌感染临床、治疗与预后,明确综合医院光滑念珠菌感染的现状及特征,为临床对光滑念珠菌感染的诊治提供参考。[方 法]对昆明医科大学第一附属医院2015年1月至2019年12月期间的住院病例进行回顾性分析,收集深部真菌感染病例和光滑念珠菌感染病例患者的一般情况、原发病相关情况、真菌感染情况、使用抗真菌药物的相关信息,进行统计分析。采用
[目的]慢性心力衰竭(CHF)是一组由于心室舒张充盈及(或)收缩射血功能受损导致的临床综合征,是各种心血管疾病的终末期表现。而心脏再同步起搏(CRT)在现有非药物治疗中有着中流砥柱的作用,左束支区域起搏(LBBP)通过纠正阻滞的左束支实现CRT,是更符合生理性的CRT选择。有研究认为真性左束支传导阻滞(t-LBBB)患者QRS波切迹时限代表着电激动从室间隔左室内膜面至左室侧后壁传导过程,与患者左室
[目 的]探讨云南临沧市耿马县登革热流行趋势、临床特征、血清型及基因型特点,为当地制定有效的登革热防控和诊疗方案提供依据。[方法]采集2019年云南省临沧市耿马县登革热患者急性血清,采用BHK细胞培养法分离登革病毒及采用实时荧光定量PCR法鉴定登革病毒血清型;采用RT-PCR法获取登革病毒E基因序列,在GenBank中搜索并下载同源性较高的参考序列,采用Chromas 2、SeqMan、Mega5