于2010年12月（冬季）和2011年6月（夏季）采集了大亚湾海域9个站位的表层水样，对水体中的可培养细菌经分离纯化培养后进行单菌落PCR扩增并测序，所得序列进行分子鉴定和系统分析。同时提取了水样中细菌的总DNA，利用PCR-DGGE技术对大亚湾海域浮游细菌的群落结构组成进行分析。结果共从9个站点的表层水体中共分离得到70株菌株，分属35个种。其中α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）和放线菌纲（Actinobacteria）为分离的最多的两大类，分离率分别为40%和35.7%；而β-变形菌纲（Betaproteobacteria）仅分离到1株（1.4%）。此外，还分离得到盖球菌属（Kytococcus）、间胞囊菌属（Intrasporangium）等非常见菌株。大亚湾海域表层水体可培养细菌丰富的种类多样性以及较高的α-变形菌分离率，说明了该海域良好的水质，同时也是潜在的微生物菌种资源库。所得到的DGGE指纹图谱经分析显示，各站位条带丰富度、Shannon-Weaver多样性指数PieLou均匀度指数较大，而且优势条带分布一致，说明大亚湾表层水体的浮游细菌群落结构的多样性比较丰富，无明显的空间异质性；夏冬两个季节间浮游细菌的DNA指纹多样性也不存在明显差异，但夏季DGGE条带数较高，而冬季种类多样性较高。研究结果说明，大亚湾海域丰富的营养盐、较高的温度使该海域浮游细菌种类丰富，同时较为均一的环境条件和亚热带气候特征导致浮游细胞群落的分子结构不具有明显的空间和季节差异。