苹果是新疆南疆盆地主要栽培果树,但新疆南疆干旱少雨,土壤贫瘠,长期以来清耕制度使得果园土壤保肥保水能力变差,进而影响果实品质和产量。本研究以生草区和清耕区为试验样点,对比生草区与清耕区的小气候因子、土壤理化性质及苹果的光合特性、叶片质量、果实品质等方面的差异,利用因子分析、灰色关联度分析、回归分析、通径分析、模糊综合评价法对清耕区与生草区苹果的冠层小气候、土壤理化指标、净光合速率的主要决定因子与限制因子、苹果果实品质等进行了分析评价,旨在揭示自然生草对改善果园生态环境及提升果实品质的影响,为苹果园土壤管理提供一定的理论依据和技术指导。所得主要研究结果如下:（1）自然生草对苹果树冠下层、中层的降温效果优于上层,对下层的增湿效果及削弱光强的能力均优于中层和上层;自然生草降低了果园各土层的地温,降温效果随土层深度的增加而减弱。冠层小气候的综合评价表明自然生草改善了苹果各冠层的小气候环境,其调节作用随苹果冠层高度的增加而减弱。（2）自然生草降低了果园土壤的pH-值、电导率、容重及水溶性盐含量,增加了果园土壤的有机质、速效氮、速效磷、速效钾、全氮、全磷、全钾含量,土层越浅、生草期越长效果越明显。自然生草增加了各时期果园土壤的含水量、总孔隙度、通气孔隙度、持水孔隙度及0-20cm土层土壤的Zn、Mn、Fe含量。土壤理化性质的灰色关联度分析表明,自然生草对果园各层土壤的改良作用均大于清耕区,且其改良效果随土层深度的增加而减弱。土壤物理性质对有机质的回归分析表明,在一定土层范围内果园土壤的pH-值、含水量、容重均随土层深度的增加而增加,总孔隙度、电导率、水溶性盐含量均随土层深度的增加而降低。（3）自然生草提高了苹果叶片的P_n、G_s、WUE、LUE,降低了胞间CO₂浓度（C_i）、蒸腾速率（T_r）。通径分析发现,清耕处理气温（T_a）对P_n有限制作用,G_s、C_i、T_r和空气相对湿度（RH）是P_n的主要决定因子;自然生草处理T_a和RH对P_n有限制作用,G_s、C_i和T_r是P_n的主要决定因子。（4）自然生草提高了苹果的叶片质量,苹果叶片的叶长、叶宽、叶面积、叶片厚度、鲜重、干重及比叶重明显增加;促进了苹果叶片的叶绿素合成,苹果叶片的叶绿素a、叶绿素b、类胡萝卜素及总叶绿素含量明显增加,叶绿素SPAD值明显增大;增加了苹果叶片的养分与矿质元素含量,苹果叶片的全氮、全钾及Ca、Mg、Cu、B含量明显增加。（5）自然生草改善了苹果的果实外观品质,苹果的单果重、果实硬度、着色果率、着色指数明显增加;提高了苹果的果实内在品质,苹果的可溶性蛋白、维生素C含量及糖酸比增加,可滴定酸含量降低;改变了果皮、果肉的花青苷与叶绿素含量,果皮、果肉的花青苷含量明显增加,叶绿素a、叶绿素b、总叶绿素含量均明显降低。苹果品质性状的综合评价表明,自然生草可明显提高苹果的果实综合品质。